Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWW1

C1QL3, Complement C1q-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1QL3Q5VWW1 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
C1QL3Q5VWW1 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
C1QL3Q5VWW1 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
C1QL3Q5VWW1 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
C1QL3Q5VWW1 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
C1QL3Q5VWW1 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
C1QL3Q5VWW1 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
C1QL3Q5VWW1 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
C1QL3Q5VWW1 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
C1QL3Q5VWW1 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
C1QL3Q5VWW1 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
C1QL3Q5VWW1 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
C1QL3Q5VWW1 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
C1QL3Q5VWW1 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
C1QL3Q5VWW1 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
C1QL3Q5VWW1 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
C1QL3Q5VWW1 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
C1QL3Q5VWW1 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C1QL3Q5VWW1 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C1QL3Q5VWW1 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C1QL3Q5VWW1 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C1QL3Q5VWW1 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C1QL3Q5VWW1 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C1QL3Q5VWW1 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C1QL3Q5VWW1 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C1QL3Q5VWW1 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C1QL3Q5VWW1 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C1QL3Q5VWW1 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C1QL3Q5VWW1 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C1QL3Q5VWW1 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C1QL3Q5VWW1 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C1QL3Q5VWW1 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C1QL3Q5VWW1 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C1QL3Q5VWW1 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C1QL3Q5VWW1 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C1QL3Q5VWW1 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C1QL3Q5VWW1 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C1QL3Q5VWW1 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C1QL3Q5VWW1 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C1QL3Q5VWW1 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C1QL3Q5VWW1 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C1QL3Q5VWW1 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C1QL3Q5VWW1 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C1QL3Q5VWW1 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
C1QL3Q5VWW1 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C1QL3Q5VWW1 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C1QL3Q5VWW1 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C1QL3Q5VWW1 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C1QL3Q5VWW1 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C1QL3Q5VWW1 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C1QL3Q5VWW1 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C1QL3Q5VWW1 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C1QL3Q5VWW1 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
C1QL3Q5VWW1 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C1QL3Q5VWW1 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C1QL3Q5VWW1 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C1QL3Q5VWW1 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C1QL3Q5VWW1 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C1QL3Q5VWW1 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
C1QL3Q5VWW1 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C1QL3Q5VWW1 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C1QL3Q5VWW1 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
C1QL3Q5VWW1 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
C1QL3Q5VWW1 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C1QL3Q5VWW1 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C1QL3Q5VWW1 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
C1QL3Q5VWW1 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C1QL3Q5VWW1 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C1QL3Q5VWW1 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C1QL3Q5VWW1 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C1QL3Q5VWW1 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C1QL3Q5VWW1 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
C1QL3Q5VWW1 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C1QL3Q5VWW1 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C1QL3Q5VWW1 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C1QL3Q5VWW1 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C1QL3Q5VWW1 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C1QL3Q5VWW1 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C1QL3Q5VWW1 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
C1QL3Q5VWW1 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C1QL3Q5VWW1 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
C1QL3Q5VWW1 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C1QL3Q5VWW1 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C1QL3Q5VWW1 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C1QL3Q5VWW1 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C1QL3Q5VWW1 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C1QL3Q5VWW1 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C1QL3Q5VWW1 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C1QL3Q5VWW1 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C1QL3Q5VWW1 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C1QL3Q5VWW1 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C1QL3Q5VWW1 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C1QL3Q5VWW1 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C1QL3Q5VWW1 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C1QL3Q5VWW1 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C1QL3Q5VWW1 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C1QL3Q5VWW1 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C1QL3Q5VWW1 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C1QL3Q5VWW1 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C1QL3Q5VWW1 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms