Protein–RNA interactions for Protein: Q5UIP0

RIF1, Telomere-associated protein RIF1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIF1Q5UIP0 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RIF1Q5UIP0 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
RIF1Q5UIP0 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RIF1Q5UIP0 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RIF1Q5UIP0 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RIF1Q5UIP0 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RIF1Q5UIP0 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RIF1Q5UIP0 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RIF1Q5UIP0 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RIF1Q5UIP0 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RIF1Q5UIP0 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
RIF1Q5UIP0 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RIF1Q5UIP0 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RIF1Q5UIP0 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RIF1Q5UIP0 AC080129.2-201ENST00000418353 430 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RIF1Q5UIP0 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RIF1Q5UIP0 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
RIF1Q5UIP0 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
RIF1Q5UIP0 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RIF1Q5UIP0 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RIF1Q5UIP0 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RIF1Q5UIP0 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RIF1Q5UIP0 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RIF1Q5UIP0 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RIF1Q5UIP0 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RIF1Q5UIP0 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RIF1Q5UIP0 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RIF1Q5UIP0 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RIF1Q5UIP0 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RIF1Q5UIP0 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RIF1Q5UIP0 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RIF1Q5UIP0 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RIF1Q5UIP0 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
RIF1Q5UIP0 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RIF1Q5UIP0 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RIF1Q5UIP0 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RIF1Q5UIP0 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RIF1Q5UIP0 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RIF1Q5UIP0 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RIF1Q5UIP0 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RIF1Q5UIP0 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RIF1Q5UIP0 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RIF1Q5UIP0 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
RIF1Q5UIP0 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RIF1Q5UIP0 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RIF1Q5UIP0 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RIF1Q5UIP0 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RIF1Q5UIP0 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RIF1Q5UIP0 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RIF1Q5UIP0 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RIF1Q5UIP0 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RIF1Q5UIP0 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
RIF1Q5UIP0 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RIF1Q5UIP0 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
RIF1Q5UIP0 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RIF1Q5UIP0 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RIF1Q5UIP0 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RIF1Q5UIP0 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RIF1Q5UIP0 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RIF1Q5UIP0 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
RIF1Q5UIP0 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RIF1Q5UIP0 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RIF1Q5UIP0 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RIF1Q5UIP0 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RIF1Q5UIP0 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RIF1Q5UIP0 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
RIF1Q5UIP0 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RIF1Q5UIP0 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
RIF1Q5UIP0 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RIF1Q5UIP0 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
RIF1Q5UIP0 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RIF1Q5UIP0 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RIF1Q5UIP0 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RIF1Q5UIP0 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RIF1Q5UIP0 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
RIF1Q5UIP0 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RIF1Q5UIP0 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RIF1Q5UIP0 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RIF1Q5UIP0 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RIF1Q5UIP0 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RIF1Q5UIP0 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RIF1Q5UIP0 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RIF1Q5UIP0 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RIF1Q5UIP0 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RIF1Q5UIP0 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RIF1Q5UIP0 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RIF1Q5UIP0 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
RIF1Q5UIP0 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RIF1Q5UIP0 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RIF1Q5UIP0 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RIF1Q5UIP0 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
RIF1Q5UIP0 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RIF1Q5UIP0 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RIF1Q5UIP0 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RIF1Q5UIP0 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RIF1Q5UIP0 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RIF1Q5UIP0 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
RIF1Q5UIP0 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RIF1Q5UIP0 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RIF1Q5UIP0 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms