Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRE5

NUP188, Nucleoporin NUP188 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP188Q5SRE5 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NUP188Q5SRE5 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NUP188Q5SRE5 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NUP188Q5SRE5 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NUP188Q5SRE5 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NUP188Q5SRE5 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NUP188Q5SRE5 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NUP188Q5SRE5 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NUP188Q5SRE5 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NUP188Q5SRE5 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NUP188Q5SRE5 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NUP188Q5SRE5 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NUP188Q5SRE5 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NUP188Q5SRE5 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NUP188Q5SRE5 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NUP188Q5SRE5 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NUP188Q5SRE5 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NUP188Q5SRE5 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NUP188Q5SRE5 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NUP188Q5SRE5 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NUP188Q5SRE5 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NUP188Q5SRE5 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NUP188Q5SRE5 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NUP188Q5SRE5 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NUP188Q5SRE5 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NUP188Q5SRE5 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NUP188Q5SRE5 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NUP188Q5SRE5 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NUP188Q5SRE5 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NUP188Q5SRE5 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NUP188Q5SRE5 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NUP188Q5SRE5 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
NUP188Q5SRE5 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
NUP188Q5SRE5 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NUP188Q5SRE5 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NUP188Q5SRE5 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NUP188Q5SRE5 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NUP188Q5SRE5 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NUP188Q5SRE5 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NUP188Q5SRE5 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NUP188Q5SRE5 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
NUP188Q5SRE5 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NUP188Q5SRE5 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NUP188Q5SRE5 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NUP188Q5SRE5 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
NUP188Q5SRE5 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NUP188Q5SRE5 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NUP188Q5SRE5 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NUP188Q5SRE5 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NUP188Q5SRE5 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NUP188Q5SRE5 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NUP188Q5SRE5 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NUP188Q5SRE5 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NUP188Q5SRE5 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
NUP188Q5SRE5 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
NUP188Q5SRE5 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NUP188Q5SRE5 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NUP188Q5SRE5 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NUP188Q5SRE5 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
NUP188Q5SRE5 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NUP188Q5SRE5 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NUP188Q5SRE5 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NUP188Q5SRE5 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NUP188Q5SRE5 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NUP188Q5SRE5 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NUP188Q5SRE5 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NUP188Q5SRE5 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NUP188Q5SRE5 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NUP188Q5SRE5 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NUP188Q5SRE5 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NUP188Q5SRE5 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NUP188Q5SRE5 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NUP188Q5SRE5 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NUP188Q5SRE5 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
NUP188Q5SRE5 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NUP188Q5SRE5 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NUP188Q5SRE5 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
NUP188Q5SRE5 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NUP188Q5SRE5 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
NUP188Q5SRE5 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NUP188Q5SRE5 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NUP188Q5SRE5 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NUP188Q5SRE5 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NUP188Q5SRE5 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NUP188Q5SRE5 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NUP188Q5SRE5 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
NUP188Q5SRE5 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
NUP188Q5SRE5 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
NUP188Q5SRE5 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
NUP188Q5SRE5 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NUP188Q5SRE5 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NUP188Q5SRE5 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
NUP188Q5SRE5 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NUP188Q5SRE5 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NUP188Q5SRE5 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NUP188Q5SRE5 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NUP188Q5SRE5 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
NUP188Q5SRE5 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NUP188Q5SRE5 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NUP188Q5SRE5 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms