Protein–RNA interactions for Protein: Q2WGJ6

KLHL38, Kelch-like protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL38Q2WGJ6 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KLHL38Q2WGJ6 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KLHL38Q2WGJ6 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KLHL38Q2WGJ6 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KLHL38Q2WGJ6 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KLHL38Q2WGJ6 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
KLHL38Q2WGJ6 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KLHL38Q2WGJ6 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KLHL38Q2WGJ6 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KLHL38Q2WGJ6 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
KLHL38Q2WGJ6 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KLHL38Q2WGJ6 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KLHL38Q2WGJ6 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KLHL38Q2WGJ6 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KLHL38Q2WGJ6 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KLHL38Q2WGJ6 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KLHL38Q2WGJ6 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KLHL38Q2WGJ6 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KLHL38Q2WGJ6 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KLHL38Q2WGJ6 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KLHL38Q2WGJ6 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
KLHL38Q2WGJ6 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
KLHL38Q2WGJ6 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KLHL38Q2WGJ6 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KLHL38Q2WGJ6 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
KLHL38Q2WGJ6 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
KLHL38Q2WGJ6 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
KLHL38Q2WGJ6 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
KLHL38Q2WGJ6 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KLHL38Q2WGJ6 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
KLHL38Q2WGJ6 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KLHL38Q2WGJ6 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KLHL38Q2WGJ6 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KLHL38Q2WGJ6 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
KLHL38Q2WGJ6 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
KLHL38Q2WGJ6 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
KLHL38Q2WGJ6 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KLHL38Q2WGJ6 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
KLHL38Q2WGJ6 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
KLHL38Q2WGJ6 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KLHL38Q2WGJ6 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
KLHL38Q2WGJ6 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KLHL38Q2WGJ6 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
KLHL38Q2WGJ6 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KLHL38Q2WGJ6 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
KLHL38Q2WGJ6 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KLHL38Q2WGJ6 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KLHL38Q2WGJ6 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
KLHL38Q2WGJ6 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLHL38Q2WGJ6 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLHL38Q2WGJ6 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
KLHL38Q2WGJ6 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLHL38Q2WGJ6 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLHL38Q2WGJ6 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLHL38Q2WGJ6 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLHL38Q2WGJ6 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLHL38Q2WGJ6 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLHL38Q2WGJ6 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLHL38Q2WGJ6 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLHL38Q2WGJ6 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLHL38Q2WGJ6 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLHL38Q2WGJ6 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLHL38Q2WGJ6 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLHL38Q2WGJ6 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLHL38Q2WGJ6 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
KLHL38Q2WGJ6 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLHL38Q2WGJ6 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLHL38Q2WGJ6 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLHL38Q2WGJ6 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLHL38Q2WGJ6 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLHL38Q2WGJ6 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLHL38Q2WGJ6 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLHL38Q2WGJ6 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLHL38Q2WGJ6 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLHL38Q2WGJ6 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLHL38Q2WGJ6 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLHL38Q2WGJ6 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLHL38Q2WGJ6 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLHL38Q2WGJ6 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLHL38Q2WGJ6 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLHL38Q2WGJ6 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLHL38Q2WGJ6 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLHL38Q2WGJ6 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLHL38Q2WGJ6 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLHL38Q2WGJ6 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLHL38Q2WGJ6 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLHL38Q2WGJ6 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
KLHL38Q2WGJ6 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
KLHL38Q2WGJ6 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
KLHL38Q2WGJ6 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
KLHL38Q2WGJ6 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
KLHL38Q2WGJ6 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
KLHL38Q2WGJ6 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
KLHL38Q2WGJ6 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KLHL38Q2WGJ6 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KLHL38Q2WGJ6 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KLHL38Q2WGJ6 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KLHL38Q2WGJ6 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KLHL38Q2WGJ6 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KLHL38Q2WGJ6 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms