Protein–RNA interactions for Protein: Q15113

PCOLCE, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCOLCEQ15113 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PCOLCEQ15113 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PCOLCEQ15113 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PCOLCEQ15113 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PCOLCEQ15113 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PCOLCEQ15113 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PCOLCEQ15113 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PCOLCEQ15113 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PCOLCEQ15113 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PCOLCEQ15113 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PCOLCEQ15113 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PCOLCEQ15113 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PCOLCEQ15113 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PCOLCEQ15113 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PCOLCEQ15113 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PCOLCEQ15113 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PCOLCEQ15113 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PCOLCEQ15113 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PCOLCEQ15113 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PCOLCEQ15113 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PCOLCEQ15113 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PCOLCEQ15113 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PCOLCEQ15113 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PCOLCEQ15113 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
PCOLCEQ15113 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PCOLCEQ15113 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PCOLCEQ15113 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
PCOLCEQ15113 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PCOLCEQ15113 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PCOLCEQ15113 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
PCOLCEQ15113 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PCOLCEQ15113 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PCOLCEQ15113 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PCOLCEQ15113 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
PCOLCEQ15113 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PCOLCEQ15113 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PCOLCEQ15113 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PCOLCEQ15113 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
PCOLCEQ15113 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PCOLCEQ15113 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PCOLCEQ15113 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PCOLCEQ15113 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
PCOLCEQ15113 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PCOLCEQ15113 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PCOLCEQ15113 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PCOLCEQ15113 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PCOLCEQ15113 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PCOLCEQ15113 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PCOLCEQ15113 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PCOLCEQ15113 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PCOLCEQ15113 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PCOLCEQ15113 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PCOLCEQ15113 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PCOLCEQ15113 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PCOLCEQ15113 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PCOLCEQ15113 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PCOLCEQ15113 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PCOLCEQ15113 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PCOLCEQ15113 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PCOLCEQ15113 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PCOLCEQ15113 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PCOLCEQ15113 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PCOLCEQ15113 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PCOLCEQ15113 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PCOLCEQ15113 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PCOLCEQ15113 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PCOLCEQ15113 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
PCOLCEQ15113 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PCOLCEQ15113 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PCOLCEQ15113 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PCOLCEQ15113 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PCOLCEQ15113 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PCOLCEQ15113 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PCOLCEQ15113 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PCOLCEQ15113 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PCOLCEQ15113 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PCOLCEQ15113 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PCOLCEQ15113 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PCOLCEQ15113 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PCOLCEQ15113 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PCOLCEQ15113 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PCOLCEQ15113 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PCOLCEQ15113 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PCOLCEQ15113 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PCOLCEQ15113 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
PCOLCEQ15113 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PCOLCEQ15113 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PCOLCEQ15113 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PCOLCEQ15113 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PCOLCEQ15113 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PCOLCEQ15113 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PCOLCEQ15113 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PCOLCEQ15113 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PCOLCEQ15113 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PCOLCEQ15113 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PCOLCEQ15113 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PCOLCEQ15113 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PCOLCEQ15113 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PCOLCEQ15113 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PCOLCEQ15113 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms