Protein–RNA interactions for Protein: Q15032

R3HDM1, R3H domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,099 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3HDM1Q15032 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
R3HDM1Q15032 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
R3HDM1Q15032 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
R3HDM1Q15032 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
R3HDM1Q15032 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
R3HDM1Q15032 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
R3HDM1Q15032 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
R3HDM1Q15032 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
R3HDM1Q15032 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
R3HDM1Q15032 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
R3HDM1Q15032 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
R3HDM1Q15032 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
R3HDM1Q15032 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
R3HDM1Q15032 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
R3HDM1Q15032 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
R3HDM1Q15032 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
R3HDM1Q15032 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
R3HDM1Q15032 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
R3HDM1Q15032 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
R3HDM1Q15032 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
R3HDM1Q15032 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
R3HDM1Q15032 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
R3HDM1Q15032 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
R3HDM1Q15032 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
R3HDM1Q15032 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
R3HDM1Q15032 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
R3HDM1Q15032 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
R3HDM1Q15032 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
R3HDM1Q15032 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
R3HDM1Q15032 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
R3HDM1Q15032 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
R3HDM1Q15032 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
R3HDM1Q15032 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
R3HDM1Q15032 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
R3HDM1Q15032 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
R3HDM1Q15032 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
R3HDM1Q15032 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
R3HDM1Q15032 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
R3HDM1Q15032 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
R3HDM1Q15032 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
R3HDM1Q15032 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
R3HDM1Q15032 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
R3HDM1Q15032 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
R3HDM1Q15032 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
R3HDM1Q15032 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
R3HDM1Q15032 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
R3HDM1Q15032 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
R3HDM1Q15032 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
R3HDM1Q15032 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
R3HDM1Q15032 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
R3HDM1Q15032 HLA-DPB2-205ENST00000435074 1188 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
R3HDM1Q15032 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
R3HDM1Q15032 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
R3HDM1Q15032 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
R3HDM1Q15032 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
R3HDM1Q15032 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
R3HDM1Q15032 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
R3HDM1Q15032 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
R3HDM1Q15032 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
R3HDM1Q15032 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
R3HDM1Q15032 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
R3HDM1Q15032 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
R3HDM1Q15032 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
R3HDM1Q15032 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
R3HDM1Q15032 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
R3HDM1Q15032 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
R3HDM1Q15032 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
R3HDM1Q15032 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
R3HDM1Q15032 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
R3HDM1Q15032 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
R3HDM1Q15032 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
R3HDM1Q15032 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
R3HDM1Q15032 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
R3HDM1Q15032 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
R3HDM1Q15032 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
R3HDM1Q15032 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
R3HDM1Q15032 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
R3HDM1Q15032 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
R3HDM1Q15032 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
R3HDM1Q15032 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
R3HDM1Q15032 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
R3HDM1Q15032 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
R3HDM1Q15032 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
R3HDM1Q15032 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
R3HDM1Q15032 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
R3HDM1Q15032 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
R3HDM1Q15032 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
R3HDM1Q15032 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
R3HDM1Q15032 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
R3HDM1Q15032 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
R3HDM1Q15032 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
R3HDM1Q15032 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
R3HDM1Q15032 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
R3HDM1Q15032 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
R3HDM1Q15032 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
R3HDM1Q15032 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
R3HDM1Q15032 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
R3HDM1Q15032 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
R3HDM1Q15032 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
R3HDM1Q15032 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
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