Protein–RNA interactions for Protein: Q14457

BECN1, Beclin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BECN1Q14457 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
BECN1Q14457 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
BECN1Q14457 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
BECN1Q14457 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
BECN1Q14457 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
BECN1Q14457 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
BECN1Q14457 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
BECN1Q14457 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
BECN1Q14457 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
BECN1Q14457 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
BECN1Q14457 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
BECN1Q14457 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
BECN1Q14457 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
BECN1Q14457 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
BECN1Q14457 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
BECN1Q14457 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
BECN1Q14457 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
BECN1Q14457 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
BECN1Q14457 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
BECN1Q14457 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
BECN1Q14457 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
BECN1Q14457 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
BECN1Q14457 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
BECN1Q14457 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
BECN1Q14457 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
BECN1Q14457 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
BECN1Q14457 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
BECN1Q14457 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
BECN1Q14457 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
BECN1Q14457 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
BECN1Q14457 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
BECN1Q14457 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
BECN1Q14457 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
BECN1Q14457 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
BECN1Q14457 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
BECN1Q14457 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
BECN1Q14457 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
BECN1Q14457 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
BECN1Q14457 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
BECN1Q14457 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
BECN1Q14457 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
BECN1Q14457 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
BECN1Q14457 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
BECN1Q14457 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
BECN1Q14457 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
BECN1Q14457 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
BECN1Q14457 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
BECN1Q14457 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
BECN1Q14457 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
BECN1Q14457 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
BECN1Q14457 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
BECN1Q14457 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
BECN1Q14457 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
BECN1Q14457 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
BECN1Q14457 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
BECN1Q14457 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
BECN1Q14457 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
BECN1Q14457 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
BECN1Q14457 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
BECN1Q14457 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
BECN1Q14457 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
BECN1Q14457 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
BECN1Q14457 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
BECN1Q14457 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
BECN1Q14457 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
BECN1Q14457 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
BECN1Q14457 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
BECN1Q14457 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
BECN1Q14457 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
BECN1Q14457 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
BECN1Q14457 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
BECN1Q14457 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
BECN1Q14457 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
BECN1Q14457 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
BECN1Q14457 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
BECN1Q14457 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
BECN1Q14457 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
BECN1Q14457 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
BECN1Q14457 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
BECN1Q14457 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
BECN1Q14457 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
BECN1Q14457 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
BECN1Q14457 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
BECN1Q14457 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
BECN1Q14457 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
BECN1Q14457 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
BECN1Q14457 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
BECN1Q14457 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
BECN1Q14457 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
BECN1Q14457 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
BECN1Q14457 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
BECN1Q14457 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
BECN1Q14457 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
BECN1Q14457 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
BECN1Q14457 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
BECN1Q14457 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
BECN1Q14457 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
BECN1Q14457 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
BECN1Q14457 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
BECN1Q14457 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
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