Protein–RNA interactions for Protein: Q13972

RASGRF1, Ras-specific guanine nucleotide-releasing factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,273 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASGRF1Q13972 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RASGRF1Q13972 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RASGRF1Q13972 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RASGRF1Q13972 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RASGRF1Q13972 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RASGRF1Q13972 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RASGRF1Q13972 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RASGRF1Q13972 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RASGRF1Q13972 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RASGRF1Q13972 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RASGRF1Q13972 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RASGRF1Q13972 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RASGRF1Q13972 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RASGRF1Q13972 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RASGRF1Q13972 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RASGRF1Q13972 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RASGRF1Q13972 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
RASGRF1Q13972 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
RASGRF1Q13972 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RASGRF1Q13972 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RASGRF1Q13972 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RASGRF1Q13972 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RASGRF1Q13972 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
RASGRF1Q13972 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RASGRF1Q13972 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
RASGRF1Q13972 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RASGRF1Q13972 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
RASGRF1Q13972 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RASGRF1Q13972 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RASGRF1Q13972 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RASGRF1Q13972 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
RASGRF1Q13972 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RASGRF1Q13972 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RASGRF1Q13972 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
RASGRF1Q13972 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RASGRF1Q13972 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RASGRF1Q13972 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RASGRF1Q13972 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RASGRF1Q13972 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RASGRF1Q13972 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RASGRF1Q13972 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RASGRF1Q13972 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
RASGRF1Q13972 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RASGRF1Q13972 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RASGRF1Q13972 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RASGRF1Q13972 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RASGRF1Q13972 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RASGRF1Q13972 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RASGRF1Q13972 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RASGRF1Q13972 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RASGRF1Q13972 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RASGRF1Q13972 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RASGRF1Q13972 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RASGRF1Q13972 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RASGRF1Q13972 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RASGRF1Q13972 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RASGRF1Q13972 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RASGRF1Q13972 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RASGRF1Q13972 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
RASGRF1Q13972 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RASGRF1Q13972 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RASGRF1Q13972 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RASGRF1Q13972 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
RASGRF1Q13972 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RASGRF1Q13972 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RASGRF1Q13972 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RASGRF1Q13972 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RASGRF1Q13972 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RASGRF1Q13972 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RASGRF1Q13972 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RASGRF1Q13972 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
RASGRF1Q13972 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RASGRF1Q13972 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RASGRF1Q13972 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RASGRF1Q13972 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RASGRF1Q13972 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RASGRF1Q13972 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RASGRF1Q13972 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RASGRF1Q13972 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RASGRF1Q13972 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RASGRF1Q13972 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RASGRF1Q13972 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RASGRF1Q13972 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RASGRF1Q13972 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RASGRF1Q13972 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RASGRF1Q13972 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RASGRF1Q13972 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RASGRF1Q13972 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RASGRF1Q13972 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RASGRF1Q13972 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RASGRF1Q13972 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RASGRF1Q13972 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RASGRF1Q13972 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RASGRF1Q13972 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RASGRF1Q13972 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RASGRF1Q13972 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RASGRF1Q13972 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RASGRF1Q13972 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RASGRF1Q13972 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RASGRF1Q13972 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.7 ms