Protein–RNA interactions for Protein: Q13554

CAMK2B, Calcium/calmodulin-dependent protein kinase type II subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMK2BQ13554 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CAMK2BQ13554 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CAMK2BQ13554 AC108718.1-201ENST00000482382 554 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CAMK2BQ13554 AC115837.2-201ENST00000522127 677 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CAMK2BQ13554 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CAMK2BQ13554 GMDS-AS1-212ENST00000534160 720 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CAMK2BQ13554 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CAMK2BQ13554 AC006518.1-201ENST00000541449 943 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CAMK2BQ13554 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CAMK2BQ13554 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CAMK2BQ13554 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CAMK2BQ13554 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CAMK2BQ13554 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CAMK2BQ13554 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CAMK2BQ13554 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CAMK2BQ13554 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CAMK2BQ13554 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CAMK2BQ13554 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CAMK2BQ13554 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CAMK2BQ13554 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CAMK2BQ13554 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CAMK2BQ13554 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CAMK2BQ13554 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CAMK2BQ13554 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CAMK2BQ13554 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CAMK2BQ13554 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CAMK2BQ13554 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CAMK2BQ13554 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CAMK2BQ13554 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CAMK2BQ13554 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CAMK2BQ13554 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CAMK2BQ13554 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CAMK2BQ13554 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CAMK2BQ13554 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CAMK2BQ13554 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CAMK2BQ13554 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CAMK2BQ13554 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CAMK2BQ13554 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CAMK2BQ13554 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
CAMK2BQ13554 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CAMK2BQ13554 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CAMK2BQ13554 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CAMK2BQ13554 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CAMK2BQ13554 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
CAMK2BQ13554 AC026790.2-201ENST00000606282 430 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
CAMK2BQ13554 MALAT1-217ENST00000620902 352 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CAMK2BQ13554 LINC01670-203ENST00000624859 977 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CAMK2BQ13554 HTR4-213ENST00000631296 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CAMK2BQ13554 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
CAMK2BQ13554 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CAMK2BQ13554 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CAMK2BQ13554 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CAMK2BQ13554 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CAMK2BQ13554 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CAMK2BQ13554 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CAMK2BQ13554 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CAMK2BQ13554 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CAMK2BQ13554 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CAMK2BQ13554 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CAMK2BQ13554 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CAMK2BQ13554 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CAMK2BQ13554 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CAMK2BQ13554 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CAMK2BQ13554 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CAMK2BQ13554 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CAMK2BQ13554 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CAMK2BQ13554 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CAMK2BQ13554 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CAMK2BQ13554 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CAMK2BQ13554 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CAMK2BQ13554 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CAMK2BQ13554 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CAMK2BQ13554 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CAMK2BQ13554 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CAMK2BQ13554 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CAMK2BQ13554 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CAMK2BQ13554 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CAMK2BQ13554 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CAMK2BQ13554 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CAMK2BQ13554 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CAMK2BQ13554 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CAMK2BQ13554 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CAMK2BQ13554 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CAMK2BQ13554 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CAMK2BQ13554 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CAMK2BQ13554 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CAMK2BQ13554 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CAMK2BQ13554 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CAMK2BQ13554 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CAMK2BQ13554 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CAMK2BQ13554 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CAMK2BQ13554 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CAMK2BQ13554 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CAMK2BQ13554 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CAMK2BQ13554 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CAMK2BQ13554 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CAMK2BQ13554 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CAMK2BQ13554 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CAMK2BQ13554 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CAMK2BQ13554 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.8 ms