Protein–RNA interactions for Protein: Q13351

KLF1, Krueppel-like factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 362 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF1Q13351 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
KLF1Q13351 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
KLF1Q13351 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
KLF1Q13351 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
KLF1Q13351 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
KLF1Q13351 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
KLF1Q13351 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
KLF1Q13351 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
KLF1Q13351 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
KLF1Q13351 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
KLF1Q13351 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
KLF1Q13351 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
KLF1Q13351 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
KLF1Q13351 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
KLF1Q13351 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
KLF1Q13351 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
KLF1Q13351 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
KLF1Q13351 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
KLF1Q13351 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
KLF1Q13351 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
KLF1Q13351 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
KLF1Q13351 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
KLF1Q13351 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
KLF1Q13351 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
KLF1Q13351 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
KLF1Q13351 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
KLF1Q13351 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
KLF1Q13351 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
KLF1Q13351 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
KLF1Q13351 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
KLF1Q13351 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
KLF1Q13351 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
KLF1Q13351 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
KLF1Q13351 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
KLF1Q13351 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
KLF1Q13351 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
KLF1Q13351 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
KLF1Q13351 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
KLF1Q13351 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
KLF1Q13351 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
KLF1Q13351 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
KLF1Q13351 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KLF1Q13351 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
KLF1Q13351 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KLF1Q13351 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
KLF1Q13351 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KLF1Q13351 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KLF1Q13351 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
KLF1Q13351 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KLF1Q13351 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KLF1Q13351 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KLF1Q13351 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KLF1Q13351 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
KLF1Q13351 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
KLF1Q13351 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KLF1Q13351 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
KLF1Q13351 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
KLF1Q13351 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KLF1Q13351 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KLF1Q13351 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
KLF1Q13351 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KLF1Q13351 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
KLF1Q13351 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
KLF1Q13351 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
KLF1Q13351 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
KLF1Q13351 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
KLF1Q13351 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
KLF1Q13351 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
KLF1Q13351 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
KLF1Q13351 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
KLF1Q13351 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KLF1Q13351 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KLF1Q13351 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KLF1Q13351 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
KLF1Q13351 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KLF1Q13351 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
KLF1Q13351 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KLF1Q13351 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KLF1Q13351 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KLF1Q13351 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
KLF1Q13351 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KLF1Q13351 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KLF1Q13351 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLF1Q13351 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLF1Q13351 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLF1Q13351 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLF1Q13351 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLF1Q13351 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLF1Q13351 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLF1Q13351 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLF1Q13351 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
KLF1Q13351 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLF1Q13351 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLF1Q13351 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
KLF1Q13351 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
KLF1Q13351 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLF1Q13351 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLF1Q13351 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLF1Q13351 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
KLF1Q13351 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
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