Protein–RNA interactions for Protein: Q13278

RIG, Putative protein RIG, humanhuman

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Length 110 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIGQ13278 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
RIGQ13278 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RIGQ13278 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
RIGQ13278 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
RIGQ13278 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
RIGQ13278 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
RIGQ13278 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RIGQ13278 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
RIGQ13278 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RIGQ13278 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RIGQ13278 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
RIGQ13278 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RIGQ13278 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
RIGQ13278 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
RIGQ13278 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
RIGQ13278 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RIGQ13278 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RIGQ13278 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
RIGQ13278 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
RIGQ13278 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RIGQ13278 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
RIGQ13278 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
RIGQ13278 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
RIGQ13278 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.27
RIGQ13278 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
RIGQ13278 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
RIGQ13278 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.27
RIGQ13278 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
RIGQ13278 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
RIGQ13278 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
RIGQ13278 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
RIGQ13278 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
RIGQ13278 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
RIGQ13278 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
RIGQ13278 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
RIGQ13278 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
RIGQ13278 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
RIGQ13278 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
RIGQ13278 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
RIGQ13278 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
RIGQ13278 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
RIGQ13278 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
RIGQ13278 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
RIGQ13278 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
RIGQ13278 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
RIGQ13278 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
RIGQ13278 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
RIGQ13278 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
RIGQ13278 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
RIGQ13278 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
RIGQ13278 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
RIGQ13278 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
RIGQ13278 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
RIGQ13278 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
RIGQ13278 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
RIGQ13278 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
RIGQ13278 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
RIGQ13278 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
RIGQ13278 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
RIGQ13278 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
RIGQ13278 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
RIGQ13278 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
RIGQ13278 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
RIGQ13278 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
RIGQ13278 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
RIGQ13278 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
RIGQ13278 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
RIGQ13278 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
RIGQ13278 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
RIGQ13278 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
RIGQ13278 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
RIGQ13278 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
RIGQ13278 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
RIGQ13278 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
RIGQ13278 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
RIGQ13278 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
RIGQ13278 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
RIGQ13278 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
RIGQ13278 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
RIGQ13278 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
RIGQ13278 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
RIGQ13278 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
RIGQ13278 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
RIGQ13278 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
RIGQ13278 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
RIGQ13278 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
RIGQ13278 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
RIGQ13278 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
RIGQ13278 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
RIGQ13278 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
RIGQ13278 DNM1P51-202ENST00000558801 8752 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
RIGQ13278 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
RIGQ13278 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
RIGQ13278 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
RIGQ13278 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
RIGQ13278 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
RIGQ13278 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
RIGQ13278 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
RIGQ13278 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
RIGQ13278 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
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