Protein–RNA interactions for Protein: Q13224

GRIN2B, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, humanhuman

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Length 1,484 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2BQ13224 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
GRIN2BQ13224 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
GRIN2BQ13224 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
GRIN2BQ13224 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
GRIN2BQ13224 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
GRIN2BQ13224 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
GRIN2BQ13224 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
GRIN2BQ13224 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
GRIN2BQ13224 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
GRIN2BQ13224 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC28.93■■■□□ 2.22
GRIN2BQ13224 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
GRIN2BQ13224 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
GRIN2BQ13224 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
GRIN2BQ13224 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
GRIN2BQ13224 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
GRIN2BQ13224 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
GRIN2BQ13224 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
GRIN2BQ13224 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
GRIN2BQ13224 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
GRIN2BQ13224 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
GRIN2BQ13224 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
GRIN2BQ13224 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
GRIN2BQ13224 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
GRIN2BQ13224 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
GRIN2BQ13224 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC28.92■■■□□ 2.22
GRIN2BQ13224 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
GRIN2BQ13224 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
GRIN2BQ13224 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
GRIN2BQ13224 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
GRIN2BQ13224 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
GRIN2BQ13224 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
GRIN2BQ13224 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
GRIN2BQ13224 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
GRIN2BQ13224 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
GRIN2BQ13224 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
GRIN2BQ13224 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
GRIN2BQ13224 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
GRIN2BQ13224 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
GRIN2BQ13224 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
GRIN2BQ13224 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
GRIN2BQ13224 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
GRIN2BQ13224 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
GRIN2BQ13224 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
GRIN2BQ13224 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
GRIN2BQ13224 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
GRIN2BQ13224 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
GRIN2BQ13224 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
GRIN2BQ13224 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
GRIN2BQ13224 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
GRIN2BQ13224 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
GRIN2BQ13224 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
GRIN2BQ13224 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
GRIN2BQ13224 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
GRIN2BQ13224 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
GRIN2BQ13224 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
GRIN2BQ13224 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
GRIN2BQ13224 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
GRIN2BQ13224 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
GRIN2BQ13224 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
GRIN2BQ13224 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
GRIN2BQ13224 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
GRIN2BQ13224 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
GRIN2BQ13224 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
GRIN2BQ13224 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
GRIN2BQ13224 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
GRIN2BQ13224 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
GRIN2BQ13224 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
GRIN2BQ13224 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
GRIN2BQ13224 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
GRIN2BQ13224 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
GRIN2BQ13224 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
GRIN2BQ13224 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
GRIN2BQ13224 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
GRIN2BQ13224 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
GRIN2BQ13224 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
GRIN2BQ13224 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
GRIN2BQ13224 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
GRIN2BQ13224 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
GRIN2BQ13224 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
GRIN2BQ13224 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
GRIN2BQ13224 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
GRIN2BQ13224 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
GRIN2BQ13224 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC28.9■■■□□ 2.22
GRIN2BQ13224 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
GRIN2BQ13224 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
GRIN2BQ13224 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
GRIN2BQ13224 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
GRIN2BQ13224 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
GRIN2BQ13224 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
GRIN2BQ13224 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
GRIN2BQ13224 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
GRIN2BQ13224 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
GRIN2BQ13224 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC28.89■■■□□ 2.22
GRIN2BQ13224 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
GRIN2BQ13224 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
GRIN2BQ13224 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
GRIN2BQ13224 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
GRIN2BQ13224 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
GRIN2BQ13224 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
GRIN2BQ13224 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
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