Protein–RNA interactions for Protein: Q13137

CALCOCO2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, humanhuman

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Length 446 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO2Q13137 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CALCOCO2Q13137 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CALCOCO2Q13137 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CALCOCO2Q13137 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CALCOCO2Q13137 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CALCOCO2Q13137 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CALCOCO2Q13137 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CALCOCO2Q13137 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CALCOCO2Q13137 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CALCOCO2Q13137 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CALCOCO2Q13137 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CALCOCO2Q13137 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CALCOCO2Q13137 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CALCOCO2Q13137 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CALCOCO2Q13137 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CALCOCO2Q13137 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CALCOCO2Q13137 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CALCOCO2Q13137 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CALCOCO2Q13137 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CALCOCO2Q13137 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CALCOCO2Q13137 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CALCOCO2Q13137 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CALCOCO2Q13137 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CALCOCO2Q13137 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CALCOCO2Q13137 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CALCOCO2Q13137 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CALCOCO2Q13137 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CALCOCO2Q13137 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CALCOCO2Q13137 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CALCOCO2Q13137 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CALCOCO2Q13137 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CALCOCO2Q13137 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CALCOCO2Q13137 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CALCOCO2Q13137 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CALCOCO2Q13137 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CALCOCO2Q13137 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CALCOCO2Q13137 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CALCOCO2Q13137 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CALCOCO2Q13137 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CALCOCO2Q13137 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CALCOCO2Q13137 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CALCOCO2Q13137 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CALCOCO2Q13137 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CALCOCO2Q13137 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CALCOCO2Q13137 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CALCOCO2Q13137 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CALCOCO2Q13137 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CALCOCO2Q13137 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CALCOCO2Q13137 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CALCOCO2Q13137 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CALCOCO2Q13137 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CALCOCO2Q13137 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CALCOCO2Q13137 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CALCOCO2Q13137 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CALCOCO2Q13137 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CALCOCO2Q13137 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CALCOCO2Q13137 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
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CALCOCO2Q13137 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CALCOCO2Q13137 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CALCOCO2Q13137 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CALCOCO2Q13137 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CALCOCO2Q13137 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CALCOCO2Q13137 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CALCOCO2Q13137 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CALCOCO2Q13137 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CALCOCO2Q13137 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CALCOCO2Q13137 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CALCOCO2Q13137 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CALCOCO2Q13137 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
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CALCOCO2Q13137 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
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CALCOCO2Q13137 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CALCOCO2Q13137 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CALCOCO2Q13137 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CALCOCO2Q13137 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CALCOCO2Q13137 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CALCOCO2Q13137 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CALCOCO2Q13137 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CALCOCO2Q13137 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CALCOCO2Q13137 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CALCOCO2Q13137 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CALCOCO2Q13137 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CALCOCO2Q13137 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CALCOCO2Q13137 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CALCOCO2Q13137 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CALCOCO2Q13137 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CALCOCO2Q13137 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CALCOCO2Q13137 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CALCOCO2Q13137 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CALCOCO2Q13137 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
CALCOCO2Q13137 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CALCOCO2Q13137 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CALCOCO2Q13137 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CALCOCO2Q13137 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CALCOCO2Q13137 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CALCOCO2Q13137 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CALCOCO2Q13137 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
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