Protein–RNA interactions for Protein: Q12860

CNTN1, Contactin-1, humanhuman

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Length 1,018 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN1Q12860 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
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CNTN1Q12860 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CNTN1Q12860 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CNTN1Q12860 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CNTN1Q12860 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CNTN1Q12860 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CNTN1Q12860 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
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CNTN1Q12860 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
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CNTN1Q12860 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CNTN1Q12860 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
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CNTN1Q12860 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CNTN1Q12860 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
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CNTN1Q12860 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CNTN1Q12860 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CNTN1Q12860 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
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CNTN1Q12860 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CNTN1Q12860 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
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CNTN1Q12860 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
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CNTN1Q12860 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
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CNTN1Q12860 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CNTN1Q12860 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
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CNTN1Q12860 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CNTN1Q12860 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CNTN1Q12860 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CNTN1Q12860 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CNTN1Q12860 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
CNTN1Q12860 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
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