Protein–RNA interactions for Protein: Q05D32

CTDSPL2, CTD small phosphatase-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSPL2Q05D32 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CTDSPL2Q05D32 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CTDSPL2Q05D32 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CTDSPL2Q05D32 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CTDSPL2Q05D32 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CTDSPL2Q05D32 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CTDSPL2Q05D32 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CTDSPL2Q05D32 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CTDSPL2Q05D32 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CTDSPL2Q05D32 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CTDSPL2Q05D32 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CTDSPL2Q05D32 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CTDSPL2Q05D32 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CTDSPL2Q05D32 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CTDSPL2Q05D32 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CTDSPL2Q05D32 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CTDSPL2Q05D32 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CTDSPL2Q05D32 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CTDSPL2Q05D32 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CTDSPL2Q05D32 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
CTDSPL2Q05D32 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CTDSPL2Q05D32 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CTDSPL2Q05D32 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CTDSPL2Q05D32 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CTDSPL2Q05D32 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CTDSPL2Q05D32 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CTDSPL2Q05D32 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CTDSPL2Q05D32 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CTDSPL2Q05D32 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CTDSPL2Q05D32 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CTDSPL2Q05D32 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CTDSPL2Q05D32 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CTDSPL2Q05D32 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CTDSPL2Q05D32 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CTDSPL2Q05D32 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CTDSPL2Q05D32 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CTDSPL2Q05D32 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CTDSPL2Q05D32 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CTDSPL2Q05D32 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CTDSPL2Q05D32 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CTDSPL2Q05D32 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CTDSPL2Q05D32 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
CTDSPL2Q05D32 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CTDSPL2Q05D32 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CTDSPL2Q05D32 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CTDSPL2Q05D32 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CTDSPL2Q05D32 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CTDSPL2Q05D32 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CTDSPL2Q05D32 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CTDSPL2Q05D32 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CTDSPL2Q05D32 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CTDSPL2Q05D32 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CTDSPL2Q05D32 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CTDSPL2Q05D32 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CTDSPL2Q05D32 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CTDSPL2Q05D32 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CTDSPL2Q05D32 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CTDSPL2Q05D32 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CTDSPL2Q05D32 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CTDSPL2Q05D32 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CTDSPL2Q05D32 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
CTDSPL2Q05D32 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CTDSPL2Q05D32 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CTDSPL2Q05D32 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CTDSPL2Q05D32 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CTDSPL2Q05D32 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CTDSPL2Q05D32 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CTDSPL2Q05D32 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CTDSPL2Q05D32 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CTDSPL2Q05D32 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CTDSPL2Q05D32 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CTDSPL2Q05D32 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CTDSPL2Q05D32 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
CTDSPL2Q05D32 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CTDSPL2Q05D32 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CTDSPL2Q05D32 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CTDSPL2Q05D32 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CTDSPL2Q05D32 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CTDSPL2Q05D32 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CTDSPL2Q05D32 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CTDSPL2Q05D32 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CTDSPL2Q05D32 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CTDSPL2Q05D32 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CTDSPL2Q05D32 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CTDSPL2Q05D32 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CTDSPL2Q05D32 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CTDSPL2Q05D32 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CTDSPL2Q05D32 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CTDSPL2Q05D32 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CTDSPL2Q05D32 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CTDSPL2Q05D32 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CTDSPL2Q05D32 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CTDSPL2Q05D32 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CTDSPL2Q05D32 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CTDSPL2Q05D32 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CTDSPL2Q05D32 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CTDSPL2Q05D32 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CTDSPL2Q05D32 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CTDSPL2Q05D32 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CTDSPL2Q05D32 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms