Protein–RNA interactions for Protein: Q02978

SLC25A11, Mitochondrial 2-oxoglutarate/malate carrier protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC25A11Q02978 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC25A11Q02978 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC25A11Q02978 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC25A11Q02978 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC25A11Q02978 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC25A11Q02978 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC25A11Q02978 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC25A11Q02978 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC25A11Q02978 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC25A11Q02978 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC25A11Q02978 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC25A11Q02978 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC25A11Q02978 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC25A11Q02978 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC25A11Q02978 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC25A11Q02978 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC25A11Q02978 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC25A11Q02978 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC25A11Q02978 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC25A11Q02978 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC25A11Q02978 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC25A11Q02978 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC25A11Q02978 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC25A11Q02978 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC25A11Q02978 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC25A11Q02978 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC25A11Q02978 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC25A11Q02978 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC25A11Q02978 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC25A11Q02978 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC25A11Q02978 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC25A11Q02978 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC25A11Q02978 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC25A11Q02978 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC25A11Q02978 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC25A11Q02978 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC25A11Q02978 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC25A11Q02978 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC25A11Q02978 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC25A11Q02978 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC25A11Q02978 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC25A11Q02978 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC25A11Q02978 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC25A11Q02978 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC25A11Q02978 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC25A11Q02978 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC25A11Q02978 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC25A11Q02978 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC25A11Q02978 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC25A11Q02978 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC25A11Q02978 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC25A11Q02978 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC25A11Q02978 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC25A11Q02978 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC25A11Q02978 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC25A11Q02978 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC25A11Q02978 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC25A11Q02978 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC25A11Q02978 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC25A11Q02978 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC25A11Q02978 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC25A11Q02978 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC25A11Q02978 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC25A11Q02978 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC25A11Q02978 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC25A11Q02978 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC25A11Q02978 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC25A11Q02978 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC25A11Q02978 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC25A11Q02978 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC25A11Q02978 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC25A11Q02978 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC25A11Q02978 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC25A11Q02978 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC25A11Q02978 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC25A11Q02978 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC25A11Q02978 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC25A11Q02978 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC25A11Q02978 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC25A11Q02978 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC25A11Q02978 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC25A11Q02978 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC25A11Q02978 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC25A11Q02978 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC25A11Q02978 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC25A11Q02978 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC25A11Q02978 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC25A11Q02978 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC25A11Q02978 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC25A11Q02978 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC25A11Q02978 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC25A11Q02978 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC25A11Q02978 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC25A11Q02978 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC25A11Q02978 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC25A11Q02978 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC25A11Q02978 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC25A11Q02978 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC25A11Q02978 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC25A11Q02978 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms