Protein–RNA interactions for Protein: P63132

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Pol protein, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P63132 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HERVK_113P63132 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HERVK_113P63132 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HERVK_113P63132 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HERVK_113P63132 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC17.46■□□□□ 0.38
HERVK_113P63132 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
HERVK_113P63132 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HERVK_113P63132 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HERVK_113P63132 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HERVK_113P63132 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HERVK_113P63132 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HERVK_113P63132 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
HERVK_113P63132 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HERVK_113P63132 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HERVK_113P63132 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HERVK_113P63132 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HERVK_113P63132 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HERVK_113P63132 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HERVK_113P63132 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
HERVK_113P63132 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
HERVK_113P63132 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
HERVK_113P63132 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HERVK_113P63132 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HERVK_113P63132 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HERVK_113P63132 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HERVK_113P63132 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
HERVK_113P63132 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HERVK_113P63132 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HERVK_113P63132 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HERVK_113P63132 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HERVK_113P63132 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HERVK_113P63132 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HERVK_113P63132 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HERVK_113P63132 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HERVK_113P63132 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HERVK_113P63132 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HERVK_113P63132 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HERVK_113P63132 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HERVK_113P63132 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HERVK_113P63132 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HERVK_113P63132 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HERVK_113P63132 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HERVK_113P63132 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HERVK_113P63132 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HERVK_113P63132 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HERVK_113P63132 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HERVK_113P63132 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HERVK_113P63132 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
HERVK_113P63132 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HERVK_113P63132 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HERVK_113P63132 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HERVK_113P63132 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HERVK_113P63132 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HERVK_113P63132 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
HERVK_113P63132 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
HERVK_113P63132 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HERVK_113P63132 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HERVK_113P63132 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HERVK_113P63132 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HERVK_113P63132 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HERVK_113P63132 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HERVK_113P63132 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HERVK_113P63132 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HERVK_113P63132 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HERVK_113P63132 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HERVK_113P63132 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HERVK_113P63132 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HERVK_113P63132 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HERVK_113P63132 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HERVK_113P63132 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HERVK_113P63132 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HERVK_113P63132 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HERVK_113P63132 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HERVK_113P63132 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HERVK_113P63132 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HERVK_113P63132 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HERVK_113P63132 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HERVK_113P63132 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HERVK_113P63132 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HERVK_113P63132 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HERVK_113P63132 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HERVK_113P63132 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HERVK_113P63132 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HERVK_113P63132 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
HERVK_113P63132 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HERVK_113P63132 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HERVK_113P63132 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HERVK_113P63132 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HERVK_113P63132 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HERVK_113P63132 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HERVK_113P63132 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
HERVK_113P63132 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HERVK_113P63132 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HERVK_113P63132 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HERVK_113P63132 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
HERVK_113P63132 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HERVK_113P63132 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HERVK_113P63132 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HERVK_113P63132 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HERVK_113P63132 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms