Protein–RNA interactions for Protein: P58512

LINC01547, Uncharacterized protein encoded by LINC01547, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01547P58512 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
LINC01547P58512 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
LINC01547P58512 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
LINC01547P58512 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
LINC01547P58512 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
LINC01547P58512 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
LINC01547P58512 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
LINC01547P58512 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
LINC01547P58512 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
LINC01547P58512 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
LINC01547P58512 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
LINC01547P58512 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
LINC01547P58512 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
LINC01547P58512 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
LINC01547P58512 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
LINC01547P58512 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
LINC01547P58512 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
LINC01547P58512 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
LINC01547P58512 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
LINC01547P58512 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.27□□□□□ -0.6
LINC01547P58512 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
LINC01547P58512 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
LINC01547P58512 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
LINC01547P58512 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
LINC01547P58512 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
LINC01547P58512 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
LINC01547P58512 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
LINC01547P58512 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
LINC01547P58512 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
LINC01547P58512 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
LINC01547P58512 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
LINC01547P58512 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
LINC01547P58512 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
LINC01547P58512 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
LINC01547P58512 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
LINC01547P58512 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
LINC01547P58512 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
LINC01547P58512 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
LINC01547P58512 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
LINC01547P58512 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC11.27□□□□□ -0.61
LINC01547P58512 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
LINC01547P58512 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
LINC01547P58512 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
LINC01547P58512 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
LINC01547P58512 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
LINC01547P58512 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
LINC01547P58512 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
LINC01547P58512 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
LINC01547P58512 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
LINC01547P58512 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
LINC01547P58512 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
LINC01547P58512 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
LINC01547P58512 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
LINC01547P58512 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
LINC01547P58512 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
LINC01547P58512 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
LINC01547P58512 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
LINC01547P58512 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
LINC01547P58512 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
LINC01547P58512 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
LINC01547P58512 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
LINC01547P58512 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
LINC01547P58512 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
LINC01547P58512 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
LINC01547P58512 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
LINC01547P58512 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
LINC01547P58512 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
LINC01547P58512 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
LINC01547P58512 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
LINC01547P58512 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
LINC01547P58512 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
LINC01547P58512 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
LINC01547P58512 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
LINC01547P58512 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
LINC01547P58512 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
LINC01547P58512 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
LINC01547P58512 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
LINC01547P58512 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
LINC01547P58512 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC11.26□□□□□ -0.61
LINC01547P58512 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
LINC01547P58512 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
LINC01547P58512 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
LINC01547P58512 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
LINC01547P58512 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
LINC01547P58512 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
LINC01547P58512 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
LINC01547P58512 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
LINC01547P58512 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
LINC01547P58512 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
LINC01547P58512 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
LINC01547P58512 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
LINC01547P58512 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
LINC01547P58512 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
LINC01547P58512 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
LINC01547P58512 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
LINC01547P58512 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
LINC01547P58512 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
LINC01547P58512 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
LINC01547P58512 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
LINC01547P58512 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms