Protein–RNA interactions for Protein: P57721

PCBP3, Poly(rC)-binding protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 371 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP3P57721 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PCBP3P57721 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PCBP3P57721 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PCBP3P57721 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PCBP3P57721 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PCBP3P57721 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PCBP3P57721 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PCBP3P57721 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PCBP3P57721 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PCBP3P57721 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PCBP3P57721 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PCBP3P57721 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PCBP3P57721 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PCBP3P57721 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PCBP3P57721 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PCBP3P57721 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PCBP3P57721 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PCBP3P57721 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
PCBP3P57721 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
PCBP3P57721 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PCBP3P57721 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PCBP3P57721 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
PCBP3P57721 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PCBP3P57721 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
PCBP3P57721 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PCBP3P57721 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PCBP3P57721 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PCBP3P57721 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
PCBP3P57721 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PCBP3P57721 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PCBP3P57721 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PCBP3P57721 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PCBP3P57721 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PCBP3P57721 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PCBP3P57721 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PCBP3P57721 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PCBP3P57721 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PCBP3P57721 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PCBP3P57721 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PCBP3P57721 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PCBP3P57721 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PCBP3P57721 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PCBP3P57721 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PCBP3P57721 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PCBP3P57721 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PCBP3P57721 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PCBP3P57721 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PCBP3P57721 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PCBP3P57721 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PCBP3P57721 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PCBP3P57721 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PCBP3P57721 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PCBP3P57721 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PCBP3P57721 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PCBP3P57721 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PCBP3P57721 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PCBP3P57721 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PCBP3P57721 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PCBP3P57721 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PCBP3P57721 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PCBP3P57721 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PCBP3P57721 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PCBP3P57721 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PCBP3P57721 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PCBP3P57721 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PCBP3P57721 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PCBP3P57721 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PCBP3P57721 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PCBP3P57721 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PCBP3P57721 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PCBP3P57721 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PCBP3P57721 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PCBP3P57721 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PCBP3P57721 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PCBP3P57721 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PCBP3P57721 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PCBP3P57721 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PCBP3P57721 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PCBP3P57721 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PCBP3P57721 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PCBP3P57721 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PCBP3P57721 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PCBP3P57721 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PCBP3P57721 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PCBP3P57721 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PCBP3P57721 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PCBP3P57721 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PCBP3P57721 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PCBP3P57721 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PCBP3P57721 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PCBP3P57721 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PCBP3P57721 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PCBP3P57721 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PCBP3P57721 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PCBP3P57721 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PCBP3P57721 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PCBP3P57721 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PCBP3P57721 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PCBP3P57721 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PCBP3P57721 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms