Protein–RNA interactions for Protein: P57059

SIK1, Serine/threonine-protein kinase SIK1, humanhuman

Predictions only

Length 783 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIK1P57059 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SIK1P57059 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SIK1P57059 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SIK1P57059 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SIK1P57059 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SIK1P57059 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SIK1P57059 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
SIK1P57059 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SIK1P57059 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SIK1P57059 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SIK1P57059 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SIK1P57059 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SIK1P57059 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SIK1P57059 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
SIK1P57059 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SIK1P57059 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SIK1P57059 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
SIK1P57059 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SIK1P57059 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SIK1P57059 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SIK1P57059 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SIK1P57059 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SIK1P57059 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SIK1P57059 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SIK1P57059 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SIK1P57059 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SIK1P57059 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SIK1P57059 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SIK1P57059 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
SIK1P57059 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SIK1P57059 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SIK1P57059 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SIK1P57059 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SIK1P57059 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SIK1P57059 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SIK1P57059 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SIK1P57059 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SIK1P57059 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SIK1P57059 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SIK1P57059 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SIK1P57059 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SIK1P57059 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SIK1P57059 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SIK1P57059 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SIK1P57059 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SIK1P57059 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SIK1P57059 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
SIK1P57059 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SIK1P57059 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
SIK1P57059 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
SIK1P57059 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SIK1P57059 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SIK1P57059 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SIK1P57059 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SIK1P57059 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SIK1P57059 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SIK1P57059 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SIK1P57059 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SIK1P57059 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SIK1P57059 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SIK1P57059 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SIK1P57059 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SIK1P57059 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SIK1P57059 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SIK1P57059 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SIK1P57059 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SIK1P57059 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SIK1P57059 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SIK1P57059 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SIK1P57059 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SIK1P57059 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SIK1P57059 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SIK1P57059 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SIK1P57059 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SIK1P57059 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SIK1P57059 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SIK1P57059 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SIK1P57059 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SIK1P57059 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SIK1P57059 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SIK1P57059 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SIK1P57059 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SIK1P57059 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SIK1P57059 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SIK1P57059 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SIK1P57059 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SIK1P57059 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SIK1P57059 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SIK1P57059 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SIK1P57059 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SIK1P57059 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SIK1P57059 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SIK1P57059 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SIK1P57059 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SIK1P57059 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SIK1P57059 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SIK1P57059 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SIK1P57059 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SIK1P57059 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SIK1P57059 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms