Protein–RNA interactions for Protein: P54725

RAD23A, UV excision repair protein RAD23 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD23AP54725 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAD23AP54725 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAD23AP54725 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAD23AP54725 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAD23AP54725 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAD23AP54725 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAD23AP54725 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAD23AP54725 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAD23AP54725 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAD23AP54725 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAD23AP54725 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAD23AP54725 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAD23AP54725 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAD23AP54725 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAD23AP54725 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAD23AP54725 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAD23AP54725 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAD23AP54725 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAD23AP54725 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAD23AP54725 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
RAD23AP54725 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAD23AP54725 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAD23AP54725 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAD23AP54725 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
RAD23AP54725 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAD23AP54725 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAD23AP54725 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAD23AP54725 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAD23AP54725 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAD23AP54725 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAD23AP54725 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAD23AP54725 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAD23AP54725 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAD23AP54725 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAD23AP54725 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAD23AP54725 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAD23AP54725 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAD23AP54725 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RAD23AP54725 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RAD23AP54725 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RAD23AP54725 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RAD23AP54725 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RAD23AP54725 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RAD23AP54725 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RAD23AP54725 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RAD23AP54725 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RAD23AP54725 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RAD23AP54725 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RAD23AP54725 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RAD23AP54725 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RAD23AP54725 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
RAD23AP54725 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
RAD23AP54725 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RAD23AP54725 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RAD23AP54725 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RAD23AP54725 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RAD23AP54725 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
RAD23AP54725 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RAD23AP54725 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RAD23AP54725 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RAD23AP54725 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RAD23AP54725 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RAD23AP54725 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RAD23AP54725 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RAD23AP54725 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RAD23AP54725 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RAD23AP54725 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RAD23AP54725 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RAD23AP54725 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RAD23AP54725 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RAD23AP54725 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RAD23AP54725 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RAD23AP54725 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RAD23AP54725 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RAD23AP54725 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RAD23AP54725 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RAD23AP54725 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RAD23AP54725 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RAD23AP54725 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RAD23AP54725 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RAD23AP54725 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RAD23AP54725 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RAD23AP54725 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RAD23AP54725 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RAD23AP54725 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RAD23AP54725 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RAD23AP54725 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RAD23AP54725 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RAD23AP54725 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RAD23AP54725 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RAD23AP54725 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RAD23AP54725 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RAD23AP54725 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
RAD23AP54725 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RAD23AP54725 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RAD23AP54725 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RAD23AP54725 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RAD23AP54725 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
RAD23AP54725 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RAD23AP54725 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms