Protein–RNA interactions for Protein: P49335

POU3F4, POU domain, class 3, transcription factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POU3F4P49335 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
POU3F4P49335 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
POU3F4P49335 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
POU3F4P49335 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
POU3F4P49335 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
POU3F4P49335 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
POU3F4P49335 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
POU3F4P49335 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
POU3F4P49335 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
POU3F4P49335 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
POU3F4P49335 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
POU3F4P49335 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
POU3F4P49335 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
POU3F4P49335 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
POU3F4P49335 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
POU3F4P49335 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
POU3F4P49335 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
POU3F4P49335 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
POU3F4P49335 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
POU3F4P49335 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
POU3F4P49335 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
POU3F4P49335 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
POU3F4P49335 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
POU3F4P49335 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
POU3F4P49335 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
POU3F4P49335 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
POU3F4P49335 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
POU3F4P49335 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
POU3F4P49335 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
POU3F4P49335 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
POU3F4P49335 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
POU3F4P49335 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
POU3F4P49335 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
POU3F4P49335 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
POU3F4P49335 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
POU3F4P49335 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
POU3F4P49335 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
POU3F4P49335 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
POU3F4P49335 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
POU3F4P49335 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
POU3F4P49335 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
POU3F4P49335 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
POU3F4P49335 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
POU3F4P49335 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
POU3F4P49335 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
POU3F4P49335 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
POU3F4P49335 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
POU3F4P49335 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
POU3F4P49335 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
POU3F4P49335 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
POU3F4P49335 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
POU3F4P49335 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
POU3F4P49335 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
POU3F4P49335 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.1
POU3F4P49335 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
POU3F4P49335 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
POU3F4P49335 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
POU3F4P49335 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
POU3F4P49335 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
POU3F4P49335 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
POU3F4P49335 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
POU3F4P49335 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
POU3F4P49335 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
POU3F4P49335 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
POU3F4P49335 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
POU3F4P49335 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
POU3F4P49335 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
POU3F4P49335 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
POU3F4P49335 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
POU3F4P49335 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
POU3F4P49335 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
POU3F4P49335 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
POU3F4P49335 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
POU3F4P49335 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
POU3F4P49335 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
POU3F4P49335 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
POU3F4P49335 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
POU3F4P49335 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
POU3F4P49335 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
POU3F4P49335 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
POU3F4P49335 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
POU3F4P49335 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
POU3F4P49335 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
POU3F4P49335 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
POU3F4P49335 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
POU3F4P49335 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
POU3F4P49335 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
POU3F4P49335 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
POU3F4P49335 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
POU3F4P49335 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
POU3F4P49335 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
POU3F4P49335 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
POU3F4P49335 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
POU3F4P49335 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
POU3F4P49335 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
POU3F4P49335 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
POU3F4P49335 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
POU3F4P49335 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
POU3F4P49335 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
POU3F4P49335 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms