Protein–RNA interactions for Protein: P46094

XCR1, Chemokine XC receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XCR1P46094 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
XCR1P46094 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
XCR1P46094 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
XCR1P46094 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
XCR1P46094 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
XCR1P46094 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
XCR1P46094 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
XCR1P46094 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
XCR1P46094 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
XCR1P46094 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
XCR1P46094 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
XCR1P46094 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
XCR1P46094 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
XCR1P46094 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
XCR1P46094 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
XCR1P46094 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
XCR1P46094 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
XCR1P46094 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
XCR1P46094 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
XCR1P46094 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
XCR1P46094 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
XCR1P46094 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
XCR1P46094 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
XCR1P46094 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
XCR1P46094 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
XCR1P46094 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
XCR1P46094 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
XCR1P46094 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
XCR1P46094 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
XCR1P46094 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
XCR1P46094 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
XCR1P46094 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
XCR1P46094 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
XCR1P46094 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
XCR1P46094 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
XCR1P46094 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
XCR1P46094 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
XCR1P46094 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
XCR1P46094 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
XCR1P46094 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
XCR1P46094 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
XCR1P46094 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
XCR1P46094 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
XCR1P46094 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
XCR1P46094 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
XCR1P46094 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
XCR1P46094 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
XCR1P46094 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
XCR1P46094 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
XCR1P46094 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
XCR1P46094 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
XCR1P46094 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
XCR1P46094 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
XCR1P46094 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
XCR1P46094 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
XCR1P46094 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
XCR1P46094 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
XCR1P46094 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
XCR1P46094 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
XCR1P46094 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
XCR1P46094 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
XCR1P46094 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
XCR1P46094 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
XCR1P46094 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
XCR1P46094 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
XCR1P46094 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
XCR1P46094 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
XCR1P46094 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
XCR1P46094 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
XCR1P46094 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
XCR1P46094 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
XCR1P46094 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
XCR1P46094 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
XCR1P46094 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
XCR1P46094 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
XCR1P46094 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
XCR1P46094 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
XCR1P46094 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
XCR1P46094 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
XCR1P46094 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
XCR1P46094 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
XCR1P46094 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
XCR1P46094 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
XCR1P46094 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
XCR1P46094 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
XCR1P46094 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
XCR1P46094 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
XCR1P46094 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
XCR1P46094 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
XCR1P46094 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
XCR1P46094 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
XCR1P46094 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
XCR1P46094 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
XCR1P46094 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
XCR1P46094 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
XCR1P46094 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
XCR1P46094 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
XCR1P46094 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
XCR1P46094 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
XCR1P46094 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms