Protein–RNA interactions for Protein: P43026

GDF5, Growth/differentiation factor 5, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF5P43026 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GDF5P43026 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GDF5P43026 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GDF5P43026 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
GDF5P43026 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GDF5P43026 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GDF5P43026 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GDF5P43026 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GDF5P43026 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
GDF5P43026 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GDF5P43026 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GDF5P43026 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GDF5P43026 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GDF5P43026 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GDF5P43026 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GDF5P43026 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GDF5P43026 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GDF5P43026 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GDF5P43026 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GDF5P43026 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GDF5P43026 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GDF5P43026 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GDF5P43026 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GDF5P43026 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GDF5P43026 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GDF5P43026 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
GDF5P43026 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GDF5P43026 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GDF5P43026 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GDF5P43026 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
GDF5P43026 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
GDF5P43026 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
GDF5P43026 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GDF5P43026 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GDF5P43026 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GDF5P43026 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GDF5P43026 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GDF5P43026 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GDF5P43026 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GDF5P43026 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GDF5P43026 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GDF5P43026 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GDF5P43026 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
GDF5P43026 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GDF5P43026 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GDF5P43026 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GDF5P43026 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GDF5P43026 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GDF5P43026 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GDF5P43026 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GDF5P43026 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GDF5P43026 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GDF5P43026 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GDF5P43026 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GDF5P43026 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GDF5P43026 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GDF5P43026 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GDF5P43026 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GDF5P43026 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GDF5P43026 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GDF5P43026 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GDF5P43026 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GDF5P43026 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GDF5P43026 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GDF5P43026 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GDF5P43026 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GDF5P43026 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GDF5P43026 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GDF5P43026 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GDF5P43026 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GDF5P43026 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GDF5P43026 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GDF5P43026 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GDF5P43026 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GDF5P43026 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GDF5P43026 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GDF5P43026 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GDF5P43026 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GDF5P43026 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
GDF5P43026 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
GDF5P43026 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
GDF5P43026 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GDF5P43026 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
GDF5P43026 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GDF5P43026 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GDF5P43026 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GDF5P43026 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GDF5P43026 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GDF5P43026 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GDF5P43026 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GDF5P43026 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GDF5P43026 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GDF5P43026 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GDF5P43026 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GDF5P43026 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GDF5P43026 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GDF5P43026 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GDF5P43026 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GDF5P43026 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GDF5P43026 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms