Protein–RNA interactions for Protein: P35244

RPA3, Replication protein A 14 kDa subunit, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA3P35244 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPA3P35244 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPA3P35244 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPA3P35244 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPA3P35244 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPA3P35244 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPA3P35244 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPA3P35244 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPA3P35244 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPA3P35244 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPA3P35244 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPA3P35244 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPA3P35244 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPA3P35244 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPA3P35244 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPA3P35244 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPA3P35244 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPA3P35244 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPA3P35244 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPA3P35244 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPA3P35244 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPA3P35244 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPA3P35244 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPA3P35244 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPA3P35244 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPA3P35244 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPA3P35244 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPA3P35244 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
RPA3P35244 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPA3P35244 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPA3P35244 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPA3P35244 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
RPA3P35244 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPA3P35244 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPA3P35244 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPA3P35244 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
RPA3P35244 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
RPA3P35244 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
RPA3P35244 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPA3P35244 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPA3P35244 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPA3P35244 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPA3P35244 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPA3P35244 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPA3P35244 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPA3P35244 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPA3P35244 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPA3P35244 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
RPA3P35244 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPA3P35244 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPA3P35244 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPA3P35244 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPA3P35244 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPA3P35244 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPA3P35244 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPA3P35244 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPA3P35244 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPA3P35244 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPA3P35244 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPA3P35244 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPA3P35244 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPA3P35244 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPA3P35244 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPA3P35244 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPA3P35244 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPA3P35244 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPA3P35244 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPA3P35244 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
RPA3P35244 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPA3P35244 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPA3P35244 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPA3P35244 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
RPA3P35244 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPA3P35244 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPA3P35244 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPA3P35244 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPA3P35244 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RPA3P35244 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RPA3P35244 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
RPA3P35244 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RPA3P35244 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RPA3P35244 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RPA3P35244 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RPA3P35244 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RPA3P35244 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RPA3P35244 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RPA3P35244 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RPA3P35244 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RPA3P35244 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RPA3P35244 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RPA3P35244 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RPA3P35244 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RPA3P35244 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RPA3P35244 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RPA3P35244 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RPA3P35244 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RPA3P35244 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RPA3P35244 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RPA3P35244 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RPA3P35244 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.9 ms