Protein–RNA interactions for Protein: P31276

HOXC13, Homeobox protein Hox-C13, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC13P31276 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXC13P31276 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXC13P31276 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXC13P31276 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXC13P31276 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXC13P31276 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXC13P31276 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXC13P31276 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXC13P31276 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXC13P31276 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXC13P31276 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXC13P31276 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXC13P31276 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXC13P31276 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXC13P31276 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXC13P31276 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXC13P31276 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXC13P31276 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXC13P31276 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXC13P31276 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXC13P31276 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXC13P31276 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXC13P31276 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXC13P31276 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXC13P31276 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXC13P31276 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXC13P31276 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXC13P31276 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXC13P31276 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXC13P31276 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXC13P31276 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXC13P31276 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXC13P31276 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXC13P31276 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXC13P31276 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXC13P31276 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXC13P31276 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXC13P31276 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXC13P31276 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXC13P31276 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXC13P31276 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXC13P31276 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXC13P31276 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXC13P31276 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXC13P31276 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXC13P31276 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXC13P31276 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXC13P31276 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXC13P31276 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXC13P31276 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXC13P31276 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXC13P31276 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXC13P31276 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXC13P31276 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXC13P31276 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXC13P31276 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXC13P31276 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXC13P31276 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXC13P31276 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXC13P31276 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXC13P31276 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXC13P31276 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXC13P31276 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXC13P31276 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXC13P31276 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXC13P31276 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXC13P31276 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXC13P31276 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXC13P31276 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXC13P31276 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXC13P31276 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXC13P31276 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXC13P31276 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXC13P31276 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXC13P31276 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXC13P31276 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXC13P31276 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXC13P31276 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXC13P31276 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXC13P31276 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXC13P31276 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXC13P31276 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXC13P31276 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXC13P31276 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXC13P31276 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXC13P31276 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXC13P31276 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXC13P31276 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXC13P31276 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXC13P31276 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXC13P31276 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXC13P31276 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXC13P31276 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXC13P31276 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXC13P31276 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXC13P31276 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXC13P31276 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXC13P31276 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXC13P31276 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXC13P31276 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms