Protein–RNA interactions for Protein: P28906

CD34, Hematopoietic progenitor cell antigen CD34, humanhuman

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD34P28906 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD34P28906 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD34P28906 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD34P28906 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD34P28906 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD34P28906 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD34P28906 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD34P28906 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD34P28906 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD34P28906 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD34P28906 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD34P28906 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD34P28906 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD34P28906 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD34P28906 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CD34P28906 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD34P28906 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD34P28906 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD34P28906 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD34P28906 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD34P28906 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD34P28906 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD34P28906 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD34P28906 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD34P28906 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD34P28906 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD34P28906 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
CD34P28906 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
CD34P28906 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD34P28906 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD34P28906 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CD34P28906 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD34P28906 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD34P28906 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD34P28906 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD34P28906 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CD34P28906 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD34P28906 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD34P28906 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD34P28906 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD34P28906 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD34P28906 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD34P28906 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD34P28906 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD34P28906 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD34P28906 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CD34P28906 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD34P28906 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CD34P28906 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD34P28906 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD34P28906 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD34P28906 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD34P28906 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD34P28906 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD34P28906 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD34P28906 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD34P28906 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD34P28906 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD34P28906 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD34P28906 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD34P28906 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD34P28906 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD34P28906 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD34P28906 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD34P28906 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD34P28906 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD34P28906 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD34P28906 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD34P28906 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD34P28906 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD34P28906 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD34P28906 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD34P28906 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD34P28906 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD34P28906 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD34P28906 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD34P28906 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD34P28906 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD34P28906 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD34P28906 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CD34P28906 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CD34P28906 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD34P28906 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD34P28906 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD34P28906 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CD34P28906 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CD34P28906 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD34P28906 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD34P28906 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD34P28906 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD34P28906 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD34P28906 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD34P28906 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CD34P28906 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD34P28906 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD34P28906 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD34P28906 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD34P28906 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD34P28906 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD34P28906 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms