Protein–RNA interactions for Protein: P28335

HTR2C, 5-hydroxytryptamine receptor 2C, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR2CP28335 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
HTR2CP28335 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
HTR2CP28335 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
HTR2CP28335 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
HTR2CP28335 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
HTR2CP28335 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
HTR2CP28335 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
HTR2CP28335 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
HTR2CP28335 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
HTR2CP28335 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
HTR2CP28335 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
HTR2CP28335 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
HTR2CP28335 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HTR2CP28335 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HTR2CP28335 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HTR2CP28335 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HTR2CP28335 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HTR2CP28335 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HTR2CP28335 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HTR2CP28335 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HTR2CP28335 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HTR2CP28335 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HTR2CP28335 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HTR2CP28335 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HTR2CP28335 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
HTR2CP28335 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HTR2CP28335 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HTR2CP28335 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HTR2CP28335 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HTR2CP28335 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HTR2CP28335 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HTR2CP28335 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HTR2CP28335 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HTR2CP28335 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HTR2CP28335 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HTR2CP28335 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HTR2CP28335 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HTR2CP28335 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HTR2CP28335 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HTR2CP28335 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HTR2CP28335 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HTR2CP28335 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HTR2CP28335 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HTR2CP28335 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HTR2CP28335 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HTR2CP28335 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HTR2CP28335 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HTR2CP28335 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HTR2CP28335 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HTR2CP28335 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HTR2CP28335 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HTR2CP28335 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HTR2CP28335 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HTR2CP28335 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
HTR2CP28335 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HTR2CP28335 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HTR2CP28335 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HTR2CP28335 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
HTR2CP28335 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
HTR2CP28335 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HTR2CP28335 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HTR2CP28335 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
HTR2CP28335 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
HTR2CP28335 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
HTR2CP28335 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HTR2CP28335 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HTR2CP28335 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HTR2CP28335 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HTR2CP28335 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HTR2CP28335 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HTR2CP28335 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HTR2CP28335 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HTR2CP28335 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HTR2CP28335 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HTR2CP28335 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HTR2CP28335 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HTR2CP28335 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HTR2CP28335 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HTR2CP28335 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HTR2CP28335 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HTR2CP28335 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HTR2CP28335 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HTR2CP28335 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HTR2CP28335 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HTR2CP28335 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HTR2CP28335 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HTR2CP28335 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HTR2CP28335 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HTR2CP28335 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HTR2CP28335 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HTR2CP28335 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HTR2CP28335 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HTR2CP28335 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HTR2CP28335 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HTR2CP28335 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HTR2CP28335 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HTR2CP28335 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HTR2CP28335 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HTR2CP28335 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HTR2CP28335 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms