Protein–RNA interactions for Protein: P26006

ITGA3, Integrin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,051 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA3P26006 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ITGA3P26006 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ITGA3P26006 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ITGA3P26006 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
ITGA3P26006 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ITGA3P26006 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ITGA3P26006 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ITGA3P26006 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ITGA3P26006 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ITGA3P26006 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ITGA3P26006 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ITGA3P26006 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ITGA3P26006 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
ITGA3P26006 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ITGA3P26006 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ITGA3P26006 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ITGA3P26006 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ITGA3P26006 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ITGA3P26006 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ITGA3P26006 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ITGA3P26006 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ITGA3P26006 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ITGA3P26006 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ITGA3P26006 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ITGA3P26006 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ITGA3P26006 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ITGA3P26006 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ITGA3P26006 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ITGA3P26006 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ITGA3P26006 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ITGA3P26006 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ITGA3P26006 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ITGA3P26006 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ITGA3P26006 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
ITGA3P26006 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ITGA3P26006 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ITGA3P26006 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ITGA3P26006 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ITGA3P26006 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ITGA3P26006 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ITGA3P26006 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ITGA3P26006 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ITGA3P26006 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ITGA3P26006 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ITGA3P26006 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ITGA3P26006 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ITGA3P26006 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ITGA3P26006 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ITGA3P26006 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
ITGA3P26006 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ITGA3P26006 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ITGA3P26006 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ITGA3P26006 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ITGA3P26006 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ITGA3P26006 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
ITGA3P26006 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ITGA3P26006 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ITGA3P26006 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ITGA3P26006 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ITGA3P26006 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ITGA3P26006 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ITGA3P26006 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ITGA3P26006 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ITGA3P26006 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ITGA3P26006 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ITGA3P26006 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
ITGA3P26006 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ITGA3P26006 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ITGA3P26006 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ITGA3P26006 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ITGA3P26006 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ITGA3P26006 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ITGA3P26006 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ITGA3P26006 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ITGA3P26006 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ITGA3P26006 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ITGA3P26006 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ITGA3P26006 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ITGA3P26006 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ITGA3P26006 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ITGA3P26006 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ITGA3P26006 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ITGA3P26006 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ITGA3P26006 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ITGA3P26006 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
ITGA3P26006 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ITGA3P26006 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ITGA3P26006 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ITGA3P26006 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ITGA3P26006 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ITGA3P26006 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ITGA3P26006 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
ITGA3P26006 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ITGA3P26006 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
ITGA3P26006 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ITGA3P26006 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ITGA3P26006 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ITGA3P26006 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ITGA3P26006 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ITGA3P26006 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms