Protein–RNA interactions for Protein: P23470

PTPRG, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase gamma, humanhuman

Predictions only

Length 1,445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRGP23470 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PTPRGP23470 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PTPRGP23470 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PTPRGP23470 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PTPRGP23470 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PTPRGP23470 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PTPRGP23470 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PTPRGP23470 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PTPRGP23470 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PTPRGP23470 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PTPRGP23470 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PTPRGP23470 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
PTPRGP23470 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
PTPRGP23470 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
PTPRGP23470 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PTPRGP23470 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PTPRGP23470 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
PTPRGP23470 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
PTPRGP23470 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PTPRGP23470 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PTPRGP23470 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PTPRGP23470 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PTPRGP23470 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PTPRGP23470 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PTPRGP23470 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PTPRGP23470 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PTPRGP23470 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PTPRGP23470 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PTPRGP23470 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PTPRGP23470 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PTPRGP23470 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PTPRGP23470 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PTPRGP23470 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PTPRGP23470 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PTPRGP23470 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PTPRGP23470 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PTPRGP23470 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PTPRGP23470 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PTPRGP23470 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PTPRGP23470 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PTPRGP23470 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PTPRGP23470 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PTPRGP23470 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PTPRGP23470 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PTPRGP23470 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
PTPRGP23470 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
PTPRGP23470 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
PTPRGP23470 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
PTPRGP23470 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
PTPRGP23470 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PTPRGP23470 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PTPRGP23470 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
PTPRGP23470 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
PTPRGP23470 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PTPRGP23470 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PTPRGP23470 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PTPRGP23470 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PTPRGP23470 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PTPRGP23470 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
PTPRGP23470 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PTPRGP23470 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PTPRGP23470 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PTPRGP23470 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PTPRGP23470 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PTPRGP23470 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PTPRGP23470 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
PTPRGP23470 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PTPRGP23470 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PTPRGP23470 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PTPRGP23470 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PTPRGP23470 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PTPRGP23470 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PTPRGP23470 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PTPRGP23470 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PTPRGP23470 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PTPRGP23470 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PTPRGP23470 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PTPRGP23470 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PTPRGP23470 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PTPRGP23470 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PTPRGP23470 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.04
PTPRGP23470 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC27.76■■■□□ 2.04
PTPRGP23470 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC27.76■■■□□ 2.04
PTPRGP23470 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.04
PTPRGP23470 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC27.76■■■□□ 2.04
PTPRGP23470 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.04
PTPRGP23470 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.04
PTPRGP23470 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC27.76■■■□□ 2.04
PTPRGP23470 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.04
PTPRGP23470 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC27.76■■■□□ 2.04
PTPRGP23470 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
PTPRGP23470 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.04
PTPRGP23470 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PTPRGP23470 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PTPRGP23470 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PTPRGP23470 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PTPRGP23470 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PTPRGP23470 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PTPRGP23470 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PTPRGP23470 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
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