Protein–RNA interactions for Protein: P20810

CAST, Calpastatin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 708 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASTP20810 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
CASTP20810 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CASTP20810 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
CASTP20810 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.3■■□□□ 1
CASTP20810 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CASTP20810 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CASTP20810 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CASTP20810 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CASTP20810 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CASTP20810 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
CASTP20810 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CASTP20810 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CASTP20810 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CASTP20810 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CASTP20810 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CASTP20810 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CASTP20810 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CASTP20810 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CASTP20810 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CASTP20810 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CASTP20810 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CASTP20810 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CASTP20810 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CASTP20810 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CASTP20810 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CASTP20810 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CASTP20810 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CASTP20810 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CASTP20810 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CASTP20810 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CASTP20810 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CASTP20810 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CASTP20810 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CASTP20810 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CASTP20810 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CASTP20810 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CASTP20810 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CASTP20810 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CASTP20810 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CASTP20810 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CASTP20810 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CASTP20810 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CASTP20810 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CASTP20810 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CASTP20810 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CASTP20810 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CASTP20810 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CASTP20810 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CASTP20810 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CASTP20810 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CASTP20810 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
CASTP20810 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
CASTP20810 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CASTP20810 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
CASTP20810 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CASTP20810 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CASTP20810 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CASTP20810 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CASTP20810 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CASTP20810 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CASTP20810 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CASTP20810 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CASTP20810 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CASTP20810 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CASTP20810 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CASTP20810 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CASTP20810 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CASTP20810 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CASTP20810 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CASTP20810 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CASTP20810 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CASTP20810 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CASTP20810 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CASTP20810 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CASTP20810 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CASTP20810 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
CASTP20810 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CASTP20810 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
CASTP20810 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CASTP20810 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CASTP20810 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CASTP20810 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CASTP20810 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
CASTP20810 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CASTP20810 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
CASTP20810 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CASTP20810 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CASTP20810 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
CASTP20810 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CASTP20810 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CASTP20810 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CASTP20810 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CASTP20810 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CASTP20810 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CASTP20810 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CASTP20810 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CASTP20810 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CASTP20810 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CASTP20810 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CASTP20810 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms