Protein–RNA interactions for Protein: P18564

ITGB6, Integrin beta-6, humanhuman

Predictions only

Length 788 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB6P18564 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ITGB6P18564 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ITGB6P18564 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ITGB6P18564 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ITGB6P18564 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ITGB6P18564 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ITGB6P18564 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ITGB6P18564 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ITGB6P18564 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
ITGB6P18564 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ITGB6P18564 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ITGB6P18564 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ITGB6P18564 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ITGB6P18564 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ITGB6P18564 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ITGB6P18564 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
ITGB6P18564 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ITGB6P18564 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ITGB6P18564 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ITGB6P18564 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ITGB6P18564 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ITGB6P18564 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ITGB6P18564 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ITGB6P18564 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ITGB6P18564 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ITGB6P18564 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ITGB6P18564 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ITGB6P18564 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ITGB6P18564 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ITGB6P18564 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ITGB6P18564 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ITGB6P18564 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ITGB6P18564 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ITGB6P18564 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ITGB6P18564 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ITGB6P18564 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ITGB6P18564 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ITGB6P18564 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ITGB6P18564 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ITGB6P18564 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ITGB6P18564 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ITGB6P18564 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ITGB6P18564 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ITGB6P18564 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ITGB6P18564 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ITGB6P18564 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ITGB6P18564 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ITGB6P18564 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ITGB6P18564 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ITGB6P18564 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
ITGB6P18564 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ITGB6P18564 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ITGB6P18564 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ITGB6P18564 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ITGB6P18564 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ITGB6P18564 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ITGB6P18564 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ITGB6P18564 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ITGB6P18564 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ITGB6P18564 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ITGB6P18564 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ITGB6P18564 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ITGB6P18564 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
ITGB6P18564 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ITGB6P18564 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ITGB6P18564 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ITGB6P18564 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ITGB6P18564 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ITGB6P18564 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ITGB6P18564 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ITGB6P18564 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ITGB6P18564 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ITGB6P18564 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ITGB6P18564 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ITGB6P18564 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ITGB6P18564 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ITGB6P18564 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ITGB6P18564 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ITGB6P18564 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
ITGB6P18564 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
ITGB6P18564 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ITGB6P18564 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ITGB6P18564 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ITGB6P18564 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ITGB6P18564 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ITGB6P18564 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ITGB6P18564 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ITGB6P18564 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ITGB6P18564 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ITGB6P18564 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ITGB6P18564 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
ITGB6P18564 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ITGB6P18564 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ITGB6P18564 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ITGB6P18564 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ITGB6P18564 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
ITGB6P18564 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ITGB6P18564 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ITGB6P18564 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ITGB6P18564 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms