Protein–RNA interactions for Protein: P11686

SFTPC, Pulmonary surfactant-associated protein C, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTPCP11686 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SFTPCP11686 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SFTPCP11686 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SFTPCP11686 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SFTPCP11686 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SFTPCP11686 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SFTPCP11686 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SFTPCP11686 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SFTPCP11686 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SFTPCP11686 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SFTPCP11686 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SFTPCP11686 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SFTPCP11686 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SFTPCP11686 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SFTPCP11686 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SFTPCP11686 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SFTPCP11686 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SFTPCP11686 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SFTPCP11686 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SFTPCP11686 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SFTPCP11686 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SFTPCP11686 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SFTPCP11686 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SFTPCP11686 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SFTPCP11686 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SFTPCP11686 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SFTPCP11686 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SFTPCP11686 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SFTPCP11686 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SFTPCP11686 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SFTPCP11686 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SFTPCP11686 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SFTPCP11686 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SFTPCP11686 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SFTPCP11686 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SFTPCP11686 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SFTPCP11686 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SFTPCP11686 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SFTPCP11686 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SFTPCP11686 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SFTPCP11686 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SFTPCP11686 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SFTPCP11686 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SFTPCP11686 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SFTPCP11686 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SFTPCP11686 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SFTPCP11686 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SFTPCP11686 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SFTPCP11686 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SFTPCP11686 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SFTPCP11686 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SFTPCP11686 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SFTPCP11686 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SFTPCP11686 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SFTPCP11686 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SFTPCP11686 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SFTPCP11686 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SFTPCP11686 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SFTPCP11686 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SFTPCP11686 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SFTPCP11686 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SFTPCP11686 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SFTPCP11686 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SFTPCP11686 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SFTPCP11686 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SFTPCP11686 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SFTPCP11686 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SFTPCP11686 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SFTPCP11686 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SFTPCP11686 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SFTPCP11686 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SFTPCP11686 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SFTPCP11686 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SFTPCP11686 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SFTPCP11686 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SFTPCP11686 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SFTPCP11686 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SFTPCP11686 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SFTPCP11686 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SFTPCP11686 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SFTPCP11686 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SFTPCP11686 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SFTPCP11686 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SFTPCP11686 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SFTPCP11686 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SFTPCP11686 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SFTPCP11686 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SFTPCP11686 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SFTPCP11686 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SFTPCP11686 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SFTPCP11686 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SFTPCP11686 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SFTPCP11686 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SFTPCP11686 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SFTPCP11686 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SFTPCP11686 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SFTPCP11686 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SFTPCP11686 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SFTPCP11686 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SFTPCP11686 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
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