Protein–RNA interactions for Protein: P0DO97

CCDC192, Coiled-coil domain-containing protein 192, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC192P0DO97 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC192P0DO97 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC192P0DO97 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC192P0DO97 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC192P0DO97 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC192P0DO97 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC192P0DO97 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC192P0DO97 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC192P0DO97 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC192P0DO97 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC192P0DO97 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC192P0DO97 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC192P0DO97 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC192P0DO97 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC192P0DO97 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC192P0DO97 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC192P0DO97 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC192P0DO97 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC192P0DO97 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC192P0DO97 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC192P0DO97 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC192P0DO97 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC192P0DO97 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC192P0DO97 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC192P0DO97 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC192P0DO97 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC192P0DO97 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC192P0DO97 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC192P0DO97 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC192P0DO97 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC192P0DO97 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC192P0DO97 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC192P0DO97 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC192P0DO97 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC192P0DO97 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC192P0DO97 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC192P0DO97 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC192P0DO97 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC192P0DO97 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC192P0DO97 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC192P0DO97 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC192P0DO97 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC192P0DO97 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC192P0DO97 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC192P0DO97 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC192P0DO97 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC192P0DO97 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC192P0DO97 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC192P0DO97 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC192P0DO97 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC192P0DO97 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC192P0DO97 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC192P0DO97 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC192P0DO97 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC192P0DO97 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC192P0DO97 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC192P0DO97 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC192P0DO97 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC192P0DO97 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC192P0DO97 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC192P0DO97 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC192P0DO97 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC192P0DO97 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC192P0DO97 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC192P0DO97 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC192P0DO97 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC192P0DO97 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC192P0DO97 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC192P0DO97 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC192P0DO97 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC192P0DO97 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC192P0DO97 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC192P0DO97 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC192P0DO97 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC192P0DO97 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC192P0DO97 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC192P0DO97 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC192P0DO97 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC192P0DO97 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC192P0DO97 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC192P0DO97 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC192P0DO97 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC192P0DO97 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC192P0DO97 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC192P0DO97 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC192P0DO97 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC192P0DO97 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC192P0DO97 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC192P0DO97 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC192P0DO97 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC192P0DO97 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC192P0DO97 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC192P0DO97 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC192P0DO97 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC192P0DO97 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC192P0DO97 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC192P0DO97 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC192P0DO97 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC192P0DO97 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CCDC192P0DO97 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms