Protein–RNA interactions for Protein: O95786

DDX58, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX58, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX58O95786 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DDX58O95786 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DDX58O95786 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DDX58O95786 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DDX58O95786 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
DDX58O95786 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
DDX58O95786 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
DDX58O95786 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
DDX58O95786 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DDX58O95786 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
DDX58O95786 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
DDX58O95786 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
DDX58O95786 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
DDX58O95786 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DDX58O95786 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
DDX58O95786 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DDX58O95786 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
DDX58O95786 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
DDX58O95786 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
DDX58O95786 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
DDX58O95786 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
DDX58O95786 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
DDX58O95786 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DDX58O95786 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DDX58O95786 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
DDX58O95786 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DDX58O95786 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DDX58O95786 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
DDX58O95786 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DDX58O95786 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
DDX58O95786 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
DDX58O95786 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
DDX58O95786 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
DDX58O95786 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
DDX58O95786 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DDX58O95786 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
DDX58O95786 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DDX58O95786 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
DDX58O95786 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
DDX58O95786 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
DDX58O95786 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
DDX58O95786 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
DDX58O95786 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DDX58O95786 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
DDX58O95786 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
DDX58O95786 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DDX58O95786 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
DDX58O95786 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
DDX58O95786 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
DDX58O95786 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
DDX58O95786 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DDX58O95786 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
DDX58O95786 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
DDX58O95786 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DDX58O95786 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DDX58O95786 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
DDX58O95786 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
DDX58O95786 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
DDX58O95786 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DDX58O95786 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DDX58O95786 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DDX58O95786 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DDX58O95786 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DDX58O95786 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DDX58O95786 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DDX58O95786 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DDX58O95786 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DDX58O95786 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
DDX58O95786 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DDX58O95786 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DDX58O95786 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DDX58O95786 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DDX58O95786 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DDX58O95786 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
DDX58O95786 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DDX58O95786 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DDX58O95786 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DDX58O95786 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DDX58O95786 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DDX58O95786 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DDX58O95786 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DDX58O95786 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DDX58O95786 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DDX58O95786 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DDX58O95786 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DDX58O95786 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
DDX58O95786 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
DDX58O95786 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
DDX58O95786 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DDX58O95786 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DDX58O95786 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DDX58O95786 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DDX58O95786 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DDX58O95786 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DDX58O95786 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
DDX58O95786 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DDX58O95786 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
DDX58O95786 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
DDX58O95786 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
DDX58O95786 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms