Protein–RNA interactions for Protein: O60225

SSX5, Protein SSX5, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX5O60225 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SSX5O60225 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SSX5O60225 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SSX5O60225 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SSX5O60225 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SSX5O60225 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SSX5O60225 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SSX5O60225 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SSX5O60225 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SSX5O60225 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SSX5O60225 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SSX5O60225 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SSX5O60225 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SSX5O60225 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SSX5O60225 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SSX5O60225 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SSX5O60225 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SSX5O60225 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SSX5O60225 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SSX5O60225 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SSX5O60225 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SSX5O60225 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SSX5O60225 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SSX5O60225 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SSX5O60225 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SSX5O60225 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SSX5O60225 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SSX5O60225 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SSX5O60225 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SSX5O60225 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SSX5O60225 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SSX5O60225 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SSX5O60225 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SSX5O60225 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SSX5O60225 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SSX5O60225 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SSX5O60225 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SSX5O60225 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SSX5O60225 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SSX5O60225 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SSX5O60225 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
SSX5O60225 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SSX5O60225 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SSX5O60225 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SSX5O60225 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SSX5O60225 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SSX5O60225 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SSX5O60225 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SSX5O60225 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SSX5O60225 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SSX5O60225 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SSX5O60225 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SSX5O60225 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SSX5O60225 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SSX5O60225 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SSX5O60225 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SSX5O60225 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SSX5O60225 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SSX5O60225 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SSX5O60225 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SSX5O60225 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SSX5O60225 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SSX5O60225 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SSX5O60225 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SSX5O60225 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SSX5O60225 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SSX5O60225 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SSX5O60225 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SSX5O60225 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SSX5O60225 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SSX5O60225 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SSX5O60225 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SSX5O60225 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SSX5O60225 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SSX5O60225 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SSX5O60225 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SSX5O60225 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SSX5O60225 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SSX5O60225 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SSX5O60225 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SSX5O60225 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SSX5O60225 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SSX5O60225 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SSX5O60225 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SSX5O60225 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SSX5O60225 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SSX5O60225 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SSX5O60225 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SSX5O60225 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SSX5O60225 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SSX5O60225 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SSX5O60225 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SSX5O60225 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SSX5O60225 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SSX5O60225 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SSX5O60225 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SSX5O60225 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SSX5O60225 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SSX5O60225 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SSX5O60225 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms