Protein–RNA interactions for Protein: O15084

ANKRD28, Serine/threonine-protein phosphatase 6 regulatory ankyrin repeat subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 1,053 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD28O15084 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ANKRD28O15084 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ANKRD28O15084 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ANKRD28O15084 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ANKRD28O15084 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ANKRD28O15084 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ANKRD28O15084 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ANKRD28O15084 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ANKRD28O15084 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ANKRD28O15084 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ANKRD28O15084 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ANKRD28O15084 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ANKRD28O15084 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ANKRD28O15084 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ANKRD28O15084 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ANKRD28O15084 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ANKRD28O15084 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ANKRD28O15084 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ANKRD28O15084 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ANKRD28O15084 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
ANKRD28O15084 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ANKRD28O15084 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ANKRD28O15084 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ANKRD28O15084 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ANKRD28O15084 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ANKRD28O15084 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ANKRD28O15084 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ANKRD28O15084 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ANKRD28O15084 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ANKRD28O15084 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ANKRD28O15084 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ANKRD28O15084 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ANKRD28O15084 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ANKRD28O15084 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ANKRD28O15084 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ANKRD28O15084 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ANKRD28O15084 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ANKRD28O15084 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ANKRD28O15084 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ANKRD28O15084 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ANKRD28O15084 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
ANKRD28O15084 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ANKRD28O15084 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ANKRD28O15084 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ANKRD28O15084 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ANKRD28O15084 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ANKRD28O15084 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ANKRD28O15084 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ANKRD28O15084 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
ANKRD28O15084 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ANKRD28O15084 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ANKRD28O15084 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ANKRD28O15084 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ANKRD28O15084 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ANKRD28O15084 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ANKRD28O15084 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ANKRD28O15084 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ANKRD28O15084 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC17■□□□□ 0.31
ANKRD28O15084 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ANKRD28O15084 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ANKRD28O15084 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ANKRD28O15084 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ANKRD28O15084 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
ANKRD28O15084 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
ANKRD28O15084 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ANKRD28O15084 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ANKRD28O15084 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC17■□□□□ 0.31
ANKRD28O15084 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ANKRD28O15084 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ANKRD28O15084 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ANKRD28O15084 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ANKRD28O15084 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ANKRD28O15084 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ANKRD28O15084 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ANKRD28O15084 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ANKRD28O15084 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ANKRD28O15084 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ANKRD28O15084 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ANKRD28O15084 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ANKRD28O15084 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ANKRD28O15084 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ANKRD28O15084 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ANKRD28O15084 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ANKRD28O15084 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ANKRD28O15084 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ANKRD28O15084 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ANKRD28O15084 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ANKRD28O15084 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ANKRD28O15084 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ANKRD28O15084 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ANKRD28O15084 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ANKRD28O15084 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ANKRD28O15084 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ANKRD28O15084 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ANKRD28O15084 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ANKRD28O15084 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ANKRD28O15084 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ANKRD28O15084 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ANKRD28O15084 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ANKRD28O15084 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms