Protein–RNA interactions for Protein: O15078

CEP290, Centrosomal protein of 290 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 2,479 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP290O15078 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CEP290O15078 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CEP290O15078 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CEP290O15078 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CEP290O15078 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CEP290O15078 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
CEP290O15078 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CEP290O15078 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CEP290O15078 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CEP290O15078 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CEP290O15078 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CEP290O15078 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CEP290O15078 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CEP290O15078 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CEP290O15078 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CEP290O15078 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
CEP290O15078 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CEP290O15078 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CEP290O15078 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CEP290O15078 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CEP290O15078 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CEP290O15078 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CEP290O15078 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CEP290O15078 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CEP290O15078 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CEP290O15078 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
CEP290O15078 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CEP290O15078 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
CEP290O15078 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
CEP290O15078 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CEP290O15078 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CEP290O15078 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CEP290O15078 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
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CEP290O15078 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CEP290O15078 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CEP290O15078 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CEP290O15078 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CEP290O15078 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CEP290O15078 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
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CEP290O15078 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CEP290O15078 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
CEP290O15078 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CEP290O15078 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
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CEP290O15078 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CEP290O15078 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CEP290O15078 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
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CEP290O15078 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CEP290O15078 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
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CEP290O15078 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
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CEP290O15078 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CEP290O15078 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
CEP290O15078 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CEP290O15078 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CEP290O15078 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
CEP290O15078 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC19.14■□□□□ 0.66
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CEP290O15078 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CEP290O15078 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
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CEP290O15078 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CEP290O15078 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CEP290O15078 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
CEP290O15078 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CEP290O15078 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CEP290O15078 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CEP290O15078 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CEP290O15078 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CEP290O15078 AC080129.2-201ENST00000418353 430 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CEP290O15078 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CEP290O15078 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CEP290O15078 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CEP290O15078 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CEP290O15078 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CEP290O15078 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CEP290O15078 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CEP290O15078 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CEP290O15078 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CEP290O15078 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CEP290O15078 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CEP290O15078 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
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