Protein–RNA interactions for Protein: O15061

SYNM, Synemin, humanhuman

Predictions only

Length 1,565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNMO15061 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SYNMO15061 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SYNMO15061 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
SYNMO15061 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SYNMO15061 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SYNMO15061 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SYNMO15061 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SYNMO15061 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
SYNMO15061 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SYNMO15061 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SYNMO15061 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SYNMO15061 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SYNMO15061 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SYNMO15061 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SYNMO15061 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SYNMO15061 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SYNMO15061 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SYNMO15061 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SYNMO15061 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SYNMO15061 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SYNMO15061 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SYNMO15061 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SYNMO15061 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SYNMO15061 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
SYNMO15061 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SYNMO15061 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SYNMO15061 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SYNMO15061 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SYNMO15061 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SYNMO15061 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SYNMO15061 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SYNMO15061 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SYNMO15061 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SYNMO15061 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SYNMO15061 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SYNMO15061 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SYNMO15061 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SYNMO15061 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SYNMO15061 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SYNMO15061 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SYNMO15061 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SYNMO15061 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SYNMO15061 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SYNMO15061 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SYNMO15061 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SYNMO15061 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SYNMO15061 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SYNMO15061 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SYNMO15061 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SYNMO15061 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SYNMO15061 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
SYNMO15061 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SYNMO15061 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SYNMO15061 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SYNMO15061 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SYNMO15061 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SYNMO15061 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SYNMO15061 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SYNMO15061 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SYNMO15061 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
SYNMO15061 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
SYNMO15061 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SYNMO15061 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SYNMO15061 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SYNMO15061 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SYNMO15061 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SYNMO15061 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SYNMO15061 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
SYNMO15061 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SYNMO15061 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SYNMO15061 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SYNMO15061 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
SYNMO15061 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SYNMO15061 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SYNMO15061 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SYNMO15061 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SYNMO15061 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SYNMO15061 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SYNMO15061 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SYNMO15061 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
SYNMO15061 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SYNMO15061 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SYNMO15061 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
SYNMO15061 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SYNMO15061 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SYNMO15061 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SYNMO15061 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SYNMO15061 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SYNMO15061 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SYNMO15061 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SYNMO15061 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
SYNMO15061 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SYNMO15061 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SYNMO15061 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
SYNMO15061 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SYNMO15061 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SYNMO15061 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SYNMO15061 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SYNMO15061 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SYNMO15061 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms