Protein–RNA interactions for Protein: O14522

PTPRT, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, humanhuman

Predictions only

Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRTO14522 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PTPRTO14522 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PTPRTO14522 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PTPRTO14522 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
PTPRTO14522 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PTPRTO14522 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
PTPRTO14522 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
PTPRTO14522 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PTPRTO14522 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PTPRTO14522 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PTPRTO14522 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PTPRTO14522 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PTPRTO14522 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PTPRTO14522 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
PTPRTO14522 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PTPRTO14522 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PTPRTO14522 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PTPRTO14522 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PTPRTO14522 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PTPRTO14522 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
PTPRTO14522 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PTPRTO14522 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PTPRTO14522 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
PTPRTO14522 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
PTPRTO14522 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
PTPRTO14522 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PTPRTO14522 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PTPRTO14522 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
PTPRTO14522 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PTPRTO14522 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PTPRTO14522 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PTPRTO14522 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PTPRTO14522 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
PTPRTO14522 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PTPRTO14522 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PTPRTO14522 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PTPRTO14522 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PTPRTO14522 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PTPRTO14522 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PTPRTO14522 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PTPRTO14522 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PTPRTO14522 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PTPRTO14522 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PTPRTO14522 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
PTPRTO14522 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PTPRTO14522 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PTPRTO14522 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PTPRTO14522 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PTPRTO14522 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PTPRTO14522 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PTPRTO14522 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
PTPRTO14522 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PTPRTO14522 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
PTPRTO14522 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PTPRTO14522 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PTPRTO14522 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PTPRTO14522 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
PTPRTO14522 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PTPRTO14522 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PTPRTO14522 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
PTPRTO14522 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PTPRTO14522 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PTPRTO14522 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PTPRTO14522 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PTPRTO14522 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PTPRTO14522 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PTPRTO14522 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PTPRTO14522 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PTPRTO14522 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PTPRTO14522 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PTPRTO14522 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
PTPRTO14522 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PTPRTO14522 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PTPRTO14522 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
PTPRTO14522 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PTPRTO14522 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PTPRTO14522 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PTPRTO14522 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PTPRTO14522 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PTPRTO14522 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PTPRTO14522 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PTPRTO14522 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PTPRTO14522 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PTPRTO14522 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PTPRTO14522 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PTPRTO14522 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PTPRTO14522 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PTPRTO14522 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PTPRTO14522 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PTPRTO14522 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
PTPRTO14522 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PTPRTO14522 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PTPRTO14522 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PTPRTO14522 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PTPRTO14522 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PTPRTO14522 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PTPRTO14522 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PTPRTO14522 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PTPRTO14522 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PTPRTO14522 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
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