Protein–RNA interactions for Protein: A8MVJ9

Putative histone PARylation factor 1-like, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A8MVJ9 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
A8MVJ9 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
A8MVJ9 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
A8MVJ9 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
A8MVJ9 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
A8MVJ9 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
A8MVJ9 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
A8MVJ9 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
A8MVJ9 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
A8MVJ9 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
A8MVJ9 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
A8MVJ9 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
A8MVJ9 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
A8MVJ9 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
A8MVJ9 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
A8MVJ9 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
A8MVJ9 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
A8MVJ9 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
A8MVJ9 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
A8MVJ9 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
A8MVJ9 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
A8MVJ9 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
A8MVJ9 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
A8MVJ9 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
A8MVJ9 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
A8MVJ9 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
A8MVJ9 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
A8MVJ9 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
A8MVJ9 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
A8MVJ9 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
A8MVJ9 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
A8MVJ9 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
A8MVJ9 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
A8MVJ9 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
A8MVJ9 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
A8MVJ9 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
A8MVJ9 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
A8MVJ9 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
A8MVJ9 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
A8MVJ9 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
A8MVJ9 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
A8MVJ9 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
A8MVJ9 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
A8MVJ9 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
A8MVJ9 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
A8MVJ9 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
A8MVJ9 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
A8MVJ9 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
A8MVJ9 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
A8MVJ9 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
A8MVJ9 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
A8MVJ9 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
A8MVJ9 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
A8MVJ9 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
A8MVJ9 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
A8MVJ9 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
A8MVJ9 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
A8MVJ9 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
A8MVJ9 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
A8MVJ9 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
A8MVJ9 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
A8MVJ9 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
A8MVJ9 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
A8MVJ9 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
A8MVJ9 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
A8MVJ9 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
A8MVJ9 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
A8MVJ9 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
A8MVJ9 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
A8MVJ9 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
A8MVJ9 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
A8MVJ9 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
A8MVJ9 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
A8MVJ9 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
A8MVJ9 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
A8MVJ9 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
A8MVJ9 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
A8MVJ9 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
A8MVJ9 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
A8MVJ9 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
A8MVJ9 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
A8MVJ9 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
A8MVJ9 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
A8MVJ9 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
A8MVJ9 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
A8MVJ9 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
A8MVJ9 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
A8MVJ9 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
A8MVJ9 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
A8MVJ9 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
A8MVJ9 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
A8MVJ9 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
A8MVJ9 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
A8MVJ9 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
A8MVJ9 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
A8MVJ9 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
A8MVJ9 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
A8MVJ9 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
A8MVJ9 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
A8MVJ9 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms