Protein–RNA interactions for Protein: A6NF36

CCDC182, Coiled-coil domain-containing protein 182, humanhuman

Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC182A6NF36 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC182A6NF36 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC182A6NF36 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC182A6NF36 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC182A6NF36 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC182A6NF36 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC182A6NF36 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC182A6NF36 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC182A6NF36 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC182A6NF36 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC182A6NF36 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC182A6NF36 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC182A6NF36 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC182A6NF36 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC182A6NF36 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC182A6NF36 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC182A6NF36 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC182A6NF36 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC182A6NF36 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC182A6NF36 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC182A6NF36 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC182A6NF36 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC182A6NF36 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC182A6NF36 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC182A6NF36 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC182A6NF36 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC182A6NF36 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC182A6NF36 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC182A6NF36 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC182A6NF36 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC182A6NF36 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC182A6NF36 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC182A6NF36 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC182A6NF36 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC182A6NF36 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC182A6NF36 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC182A6NF36 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC182A6NF36 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC182A6NF36 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC182A6NF36 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC182A6NF36 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC182A6NF36 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC182A6NF36 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC182A6NF36 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC182A6NF36 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC182A6NF36 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC182A6NF36 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC182A6NF36 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC182A6NF36 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC182A6NF36 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC182A6NF36 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC182A6NF36 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC182A6NF36 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC182A6NF36 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC182A6NF36 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC182A6NF36 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC182A6NF36 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC182A6NF36 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC182A6NF36 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC182A6NF36 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC182A6NF36 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC182A6NF36 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC182A6NF36 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC182A6NF36 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC182A6NF36 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC182A6NF36 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC182A6NF36 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC182A6NF36 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC182A6NF36 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC182A6NF36 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC182A6NF36 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC182A6NF36 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC182A6NF36 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC182A6NF36 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC182A6NF36 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC182A6NF36 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC182A6NF36 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC182A6NF36 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC182A6NF36 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC182A6NF36 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC182A6NF36 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC182A6NF36 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC182A6NF36 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC182A6NF36 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC182A6NF36 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC182A6NF36 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC182A6NF36 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC182A6NF36 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC182A6NF36 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC182A6NF36 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC182A6NF36 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC182A6NF36 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC182A6NF36 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC182A6NF36 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC182A6NF36 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC182A6NF36 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC182A6NF36 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC182A6NF36 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC182A6NF36 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC182A6NF36 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms