Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WW87

IGKV2-40, Immunoglobulin kappa variable 2-40, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 121 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGKV2-40A0A087WW87 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
IGKV2-40A0A087WW87 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
IGKV2-40A0A087WW87 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
IGKV2-40A0A087WW87 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
IGKV2-40A0A087WW87 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
IGKV2-40A0A087WW87 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
IGKV2-40A0A087WW87 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC13.56□□□□□ -0.24
IGKV2-40A0A087WW87 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC13.56□□□□□ -0.24
IGKV2-40A0A087WW87 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
IGKV2-40A0A087WW87 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
IGKV2-40A0A087WW87 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
IGKV2-40A0A087WW87 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
IGKV2-40A0A087WW87 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
IGKV2-40A0A087WW87 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
IGKV2-40A0A087WW87 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
IGKV2-40A0A087WW87 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
IGKV2-40A0A087WW87 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
IGKV2-40A0A087WW87 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
IGKV2-40A0A087WW87 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
IGKV2-40A0A087WW87 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
IGKV2-40A0A087WW87 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
IGKV2-40A0A087WW87 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
IGKV2-40A0A087WW87 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
IGKV2-40A0A087WW87 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
IGKV2-40A0A087WW87 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
IGKV2-40A0A087WW87 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
IGKV2-40A0A087WW87 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
IGKV2-40A0A087WW87 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
IGKV2-40A0A087WW87 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
IGKV2-40A0A087WW87 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
IGKV2-40A0A087WW87 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
IGKV2-40A0A087WW87 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
IGKV2-40A0A087WW87 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
IGKV2-40A0A087WW87 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
IGKV2-40A0A087WW87 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
IGKV2-40A0A087WW87 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
IGKV2-40A0A087WW87 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
IGKV2-40A0A087WW87 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
IGKV2-40A0A087WW87 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
IGKV2-40A0A087WW87 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
IGKV2-40A0A087WW87 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
IGKV2-40A0A087WW87 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
IGKV2-40A0A087WW87 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
IGKV2-40A0A087WW87 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
IGKV2-40A0A087WW87 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
IGKV2-40A0A087WW87 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
IGKV2-40A0A087WW87 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
IGKV2-40A0A087WW87 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
IGKV2-40A0A087WW87 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
IGKV2-40A0A087WW87 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
IGKV2-40A0A087WW87 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
IGKV2-40A0A087WW87 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
IGKV2-40A0A087WW87 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
IGKV2-40A0A087WW87 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
IGKV2-40A0A087WW87 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
IGKV2-40A0A087WW87 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
IGKV2-40A0A087WW87 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
IGKV2-40A0A087WW87 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
IGKV2-40A0A087WW87 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
IGKV2-40A0A087WW87 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
IGKV2-40A0A087WW87 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
IGKV2-40A0A087WW87 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
IGKV2-40A0A087WW87 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
IGKV2-40A0A087WW87 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
IGKV2-40A0A087WW87 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
IGKV2-40A0A087WW87 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
IGKV2-40A0A087WW87 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
IGKV2-40A0A087WW87 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
IGKV2-40A0A087WW87 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
IGKV2-40A0A087WW87 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
IGKV2-40A0A087WW87 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
IGKV2-40A0A087WW87 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
IGKV2-40A0A087WW87 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
IGKV2-40A0A087WW87 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
IGKV2-40A0A087WW87 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
IGKV2-40A0A087WW87 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
IGKV2-40A0A087WW87 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
IGKV2-40A0A087WW87 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
IGKV2-40A0A087WW87 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
IGKV2-40A0A087WW87 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
IGKV2-40A0A087WW87 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
IGKV2-40A0A087WW87 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
IGKV2-40A0A087WW87 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
IGKV2-40A0A087WW87 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
IGKV2-40A0A087WW87 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
IGKV2-40A0A087WW87 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
IGKV2-40A0A087WW87 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
IGKV2-40A0A087WW87 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
IGKV2-40A0A087WW87 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
IGKV2-40A0A087WW87 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
IGKV2-40A0A087WW87 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
IGKV2-40A0A087WW87 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
IGKV2-40A0A087WW87 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
IGKV2-40A0A087WW87 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
IGKV2-40A0A087WW87 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
IGKV2-40A0A087WW87 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
IGKV2-40A0A087WW87 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
IGKV2-40A0A087WW87 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
IGKV2-40A0A087WW87 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
IGKV2-40A0A087WW87 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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