Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5R8

TRAPPC1, Trafficking protein particle complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC1Q9Y5R8 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TRAPPC1Q9Y5R8 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TRAPPC1Q9Y5R8 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TRAPPC1Q9Y5R8 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
TRAPPC1Q9Y5R8 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TRAPPC1Q9Y5R8 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
TRAPPC1Q9Y5R8 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TRAPPC1Q9Y5R8 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TRAPPC1Q9Y5R8 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TRAPPC1Q9Y5R8 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TRAPPC1Q9Y5R8 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TRAPPC1Q9Y5R8 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TRAPPC1Q9Y5R8 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TRAPPC1Q9Y5R8 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
TRAPPC1Q9Y5R8 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TRAPPC1Q9Y5R8 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TRAPPC1Q9Y5R8 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TRAPPC1Q9Y5R8 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TRAPPC1Q9Y5R8 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TRAPPC1Q9Y5R8 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TRAPPC1Q9Y5R8 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TRAPPC1Q9Y5R8 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TRAPPC1Q9Y5R8 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TRAPPC1Q9Y5R8 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TRAPPC1Q9Y5R8 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TRAPPC1Q9Y5R8 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TRAPPC1Q9Y5R8 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TRAPPC1Q9Y5R8 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TRAPPC1Q9Y5R8 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TRAPPC1Q9Y5R8 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TRAPPC1Q9Y5R8 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TRAPPC1Q9Y5R8 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TRAPPC1Q9Y5R8 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TRAPPC1Q9Y5R8 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TRAPPC1Q9Y5R8 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TRAPPC1Q9Y5R8 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TRAPPC1Q9Y5R8 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TRAPPC1Q9Y5R8 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TRAPPC1Q9Y5R8 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TRAPPC1Q9Y5R8 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TRAPPC1Q9Y5R8 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TRAPPC1Q9Y5R8 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TRAPPC1Q9Y5R8 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TRAPPC1Q9Y5R8 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TRAPPC1Q9Y5R8 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TRAPPC1Q9Y5R8 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TRAPPC1Q9Y5R8 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TRAPPC1Q9Y5R8 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TRAPPC1Q9Y5R8 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TRAPPC1Q9Y5R8 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TRAPPC1Q9Y5R8 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TRAPPC1Q9Y5R8 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
TRAPPC1Q9Y5R8 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TRAPPC1Q9Y5R8 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
TRAPPC1Q9Y5R8 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TRAPPC1Q9Y5R8 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TRAPPC1Q9Y5R8 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TRAPPC1Q9Y5R8 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TRAPPC1Q9Y5R8 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TRAPPC1Q9Y5R8 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TRAPPC1Q9Y5R8 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TRAPPC1Q9Y5R8 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TRAPPC1Q9Y5R8 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TRAPPC1Q9Y5R8 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TRAPPC1Q9Y5R8 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TRAPPC1Q9Y5R8 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TRAPPC1Q9Y5R8 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TRAPPC1Q9Y5R8 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TRAPPC1Q9Y5R8 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TRAPPC1Q9Y5R8 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRAPPC1Q9Y5R8 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRAPPC1Q9Y5R8 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRAPPC1Q9Y5R8 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRAPPC1Q9Y5R8 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRAPPC1Q9Y5R8 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRAPPC1Q9Y5R8 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRAPPC1Q9Y5R8 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRAPPC1Q9Y5R8 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRAPPC1Q9Y5R8 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRAPPC1Q9Y5R8 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRAPPC1Q9Y5R8 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRAPPC1Q9Y5R8 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRAPPC1Q9Y5R8 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRAPPC1Q9Y5R8 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRAPPC1Q9Y5R8 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRAPPC1Q9Y5R8 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
TRAPPC1Q9Y5R8 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRAPPC1Q9Y5R8 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRAPPC1Q9Y5R8 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRAPPC1Q9Y5R8 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
TRAPPC1Q9Y5R8 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRAPPC1Q9Y5R8 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRAPPC1Q9Y5R8 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRAPPC1Q9Y5R8 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRAPPC1Q9Y5R8 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRAPPC1Q9Y5R8 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRAPPC1Q9Y5R8 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRAPPC1Q9Y5R8 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRAPPC1Q9Y5R8 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRAPPC1Q9Y5R8 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.2 ms