Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPS6

SETD1B, Histone-lysine N-methyltransferase SETD1B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETD1BQ9UPS6 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SETD1BQ9UPS6 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SETD1BQ9UPS6 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SETD1BQ9UPS6 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SETD1BQ9UPS6 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SETD1BQ9UPS6 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SETD1BQ9UPS6 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SETD1BQ9UPS6 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SETD1BQ9UPS6 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SETD1BQ9UPS6 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SETD1BQ9UPS6 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SETD1BQ9UPS6 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SETD1BQ9UPS6 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SETD1BQ9UPS6 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SETD1BQ9UPS6 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
SETD1BQ9UPS6 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SETD1BQ9UPS6 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SETD1BQ9UPS6 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SETD1BQ9UPS6 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SETD1BQ9UPS6 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SETD1BQ9UPS6 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SETD1BQ9UPS6 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SETD1BQ9UPS6 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SETD1BQ9UPS6 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SETD1BQ9UPS6 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SETD1BQ9UPS6 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SETD1BQ9UPS6 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SETD1BQ9UPS6 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SETD1BQ9UPS6 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
SETD1BQ9UPS6 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SETD1BQ9UPS6 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SETD1BQ9UPS6 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SETD1BQ9UPS6 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
SETD1BQ9UPS6 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SETD1BQ9UPS6 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
SETD1BQ9UPS6 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SETD1BQ9UPS6 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SETD1BQ9UPS6 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SETD1BQ9UPS6 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SETD1BQ9UPS6 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SETD1BQ9UPS6 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SETD1BQ9UPS6 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SETD1BQ9UPS6 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SETD1BQ9UPS6 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SETD1BQ9UPS6 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SETD1BQ9UPS6 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SETD1BQ9UPS6 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SETD1BQ9UPS6 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SETD1BQ9UPS6 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SETD1BQ9UPS6 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SETD1BQ9UPS6 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SETD1BQ9UPS6 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SETD1BQ9UPS6 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SETD1BQ9UPS6 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SETD1BQ9UPS6 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SETD1BQ9UPS6 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SETD1BQ9UPS6 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SETD1BQ9UPS6 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SETD1BQ9UPS6 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SETD1BQ9UPS6 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SETD1BQ9UPS6 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SETD1BQ9UPS6 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SETD1BQ9UPS6 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SETD1BQ9UPS6 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
SETD1BQ9UPS6 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SETD1BQ9UPS6 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SETD1BQ9UPS6 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SETD1BQ9UPS6 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SETD1BQ9UPS6 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SETD1BQ9UPS6 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SETD1BQ9UPS6 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SETD1BQ9UPS6 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SETD1BQ9UPS6 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SETD1BQ9UPS6 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SETD1BQ9UPS6 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
SETD1BQ9UPS6 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SETD1BQ9UPS6 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SETD1BQ9UPS6 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SETD1BQ9UPS6 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SETD1BQ9UPS6 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
SETD1BQ9UPS6 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SETD1BQ9UPS6 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SETD1BQ9UPS6 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SETD1BQ9UPS6 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SETD1BQ9UPS6 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SETD1BQ9UPS6 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SETD1BQ9UPS6 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SETD1BQ9UPS6 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SETD1BQ9UPS6 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
SETD1BQ9UPS6 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SETD1BQ9UPS6 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SETD1BQ9UPS6 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SETD1BQ9UPS6 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SETD1BQ9UPS6 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
SETD1BQ9UPS6 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
SETD1BQ9UPS6 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
SETD1BQ9UPS6 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SETD1BQ9UPS6 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SETD1BQ9UPS6 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SETD1BQ9UPS6 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms