Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ4

TRIM35, Tripartite motif-containing protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM35Q9UPQ4 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRIM35Q9UPQ4 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRIM35Q9UPQ4 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
TRIM35Q9UPQ4 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRIM35Q9UPQ4 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
TRIM35Q9UPQ4 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRIM35Q9UPQ4 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRIM35Q9UPQ4 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRIM35Q9UPQ4 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRIM35Q9UPQ4 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRIM35Q9UPQ4 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRIM35Q9UPQ4 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRIM35Q9UPQ4 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
TRIM35Q9UPQ4 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRIM35Q9UPQ4 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
TRIM35Q9UPQ4 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRIM35Q9UPQ4 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRIM35Q9UPQ4 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRIM35Q9UPQ4 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRIM35Q9UPQ4 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRIM35Q9UPQ4 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRIM35Q9UPQ4 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRIM35Q9UPQ4 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRIM35Q9UPQ4 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRIM35Q9UPQ4 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRIM35Q9UPQ4 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRIM35Q9UPQ4 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRIM35Q9UPQ4 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRIM35Q9UPQ4 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRIM35Q9UPQ4 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRIM35Q9UPQ4 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRIM35Q9UPQ4 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRIM35Q9UPQ4 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRIM35Q9UPQ4 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRIM35Q9UPQ4 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRIM35Q9UPQ4 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
TRIM35Q9UPQ4 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRIM35Q9UPQ4 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRIM35Q9UPQ4 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRIM35Q9UPQ4 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
TRIM35Q9UPQ4 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
TRIM35Q9UPQ4 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRIM35Q9UPQ4 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRIM35Q9UPQ4 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRIM35Q9UPQ4 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRIM35Q9UPQ4 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRIM35Q9UPQ4 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRIM35Q9UPQ4 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
TRIM35Q9UPQ4 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRIM35Q9UPQ4 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRIM35Q9UPQ4 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRIM35Q9UPQ4 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRIM35Q9UPQ4 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRIM35Q9UPQ4 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRIM35Q9UPQ4 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRIM35Q9UPQ4 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRIM35Q9UPQ4 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRIM35Q9UPQ4 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRIM35Q9UPQ4 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRIM35Q9UPQ4 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRIM35Q9UPQ4 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRIM35Q9UPQ4 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRIM35Q9UPQ4 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRIM35Q9UPQ4 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRIM35Q9UPQ4 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRIM35Q9UPQ4 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRIM35Q9UPQ4 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRIM35Q9UPQ4 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRIM35Q9UPQ4 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRIM35Q9UPQ4 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRIM35Q9UPQ4 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRIM35Q9UPQ4 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRIM35Q9UPQ4 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRIM35Q9UPQ4 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRIM35Q9UPQ4 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRIM35Q9UPQ4 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRIM35Q9UPQ4 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRIM35Q9UPQ4 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRIM35Q9UPQ4 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRIM35Q9UPQ4 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRIM35Q9UPQ4 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRIM35Q9UPQ4 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRIM35Q9UPQ4 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRIM35Q9UPQ4 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRIM35Q9UPQ4 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
TRIM35Q9UPQ4 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
TRIM35Q9UPQ4 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRIM35Q9UPQ4 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRIM35Q9UPQ4 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRIM35Q9UPQ4 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRIM35Q9UPQ4 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRIM35Q9UPQ4 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRIM35Q9UPQ4 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRIM35Q9UPQ4 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRIM35Q9UPQ4 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRIM35Q9UPQ4 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRIM35Q9UPQ4 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRIM35Q9UPQ4 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRIM35Q9UPQ4 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRIM35Q9UPQ4 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms