Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNN4

GTF2A1L, TFIIA-alpha and beta-like factor, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2A1LQ9UNN4 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GTF2A1LQ9UNN4 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GTF2A1LQ9UNN4 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GTF2A1LQ9UNN4 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GTF2A1LQ9UNN4 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GTF2A1LQ9UNN4 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GTF2A1LQ9UNN4 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GTF2A1LQ9UNN4 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GTF2A1LQ9UNN4 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GTF2A1LQ9UNN4 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GTF2A1LQ9UNN4 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GTF2A1LQ9UNN4 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GTF2A1LQ9UNN4 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GTF2A1LQ9UNN4 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GTF2A1LQ9UNN4 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GTF2A1LQ9UNN4 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GTF2A1LQ9UNN4 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GTF2A1LQ9UNN4 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GTF2A1LQ9UNN4 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GTF2A1LQ9UNN4 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GTF2A1LQ9UNN4 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GTF2A1LQ9UNN4 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GTF2A1LQ9UNN4 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
GTF2A1LQ9UNN4 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GTF2A1LQ9UNN4 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GTF2A1LQ9UNN4 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GTF2A1LQ9UNN4 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GTF2A1LQ9UNN4 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GTF2A1LQ9UNN4 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GTF2A1LQ9UNN4 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GTF2A1LQ9UNN4 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GTF2A1LQ9UNN4 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GTF2A1LQ9UNN4 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GTF2A1LQ9UNN4 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GTF2A1LQ9UNN4 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GTF2A1LQ9UNN4 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
GTF2A1LQ9UNN4 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GTF2A1LQ9UNN4 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GTF2A1LQ9UNN4 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GTF2A1LQ9UNN4 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GTF2A1LQ9UNN4 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GTF2A1LQ9UNN4 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GTF2A1LQ9UNN4 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GTF2A1LQ9UNN4 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GTF2A1LQ9UNN4 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GTF2A1LQ9UNN4 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GTF2A1LQ9UNN4 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GTF2A1LQ9UNN4 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GTF2A1LQ9UNN4 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GTF2A1LQ9UNN4 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GTF2A1LQ9UNN4 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GTF2A1LQ9UNN4 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GTF2A1LQ9UNN4 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GTF2A1LQ9UNN4 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
GTF2A1LQ9UNN4 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GTF2A1LQ9UNN4 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GTF2A1LQ9UNN4 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GTF2A1LQ9UNN4 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GTF2A1LQ9UNN4 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GTF2A1LQ9UNN4 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GTF2A1LQ9UNN4 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GTF2A1LQ9UNN4 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GTF2A1LQ9UNN4 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GTF2A1LQ9UNN4 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GTF2A1LQ9UNN4 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GTF2A1LQ9UNN4 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GTF2A1LQ9UNN4 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GTF2A1LQ9UNN4 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GTF2A1LQ9UNN4 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GTF2A1LQ9UNN4 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GTF2A1LQ9UNN4 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GTF2A1LQ9UNN4 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
GTF2A1LQ9UNN4 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GTF2A1LQ9UNN4 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GTF2A1LQ9UNN4 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GTF2A1LQ9UNN4 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GTF2A1LQ9UNN4 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GTF2A1LQ9UNN4 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GTF2A1LQ9UNN4 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GTF2A1LQ9UNN4 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GTF2A1LQ9UNN4 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GTF2A1LQ9UNN4 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GTF2A1LQ9UNN4 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GTF2A1LQ9UNN4 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GTF2A1LQ9UNN4 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GTF2A1LQ9UNN4 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GTF2A1LQ9UNN4 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GTF2A1LQ9UNN4 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GTF2A1LQ9UNN4 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GTF2A1LQ9UNN4 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GTF2A1LQ9UNN4 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GTF2A1LQ9UNN4 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GTF2A1LQ9UNN4 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GTF2A1LQ9UNN4 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GTF2A1LQ9UNN4 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GTF2A1LQ9UNN4 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GTF2A1LQ9UNN4 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GTF2A1LQ9UNN4 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GTF2A1LQ9UNN4 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GTF2A1LQ9UNN4 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms