Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMW8

USP18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, humanhuman

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18Q9UMW8 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
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USP18Q9UMW8 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
USP18Q9UMW8 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
USP18Q9UMW8 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
USP18Q9UMW8 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
USP18Q9UMW8 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
USP18Q9UMW8 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
USP18Q9UMW8 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
USP18Q9UMW8 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
USP18Q9UMW8 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
USP18Q9UMW8 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
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USP18Q9UMW8 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
USP18Q9UMW8 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
USP18Q9UMW8 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
USP18Q9UMW8 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
USP18Q9UMW8 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
USP18Q9UMW8 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
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USP18Q9UMW8 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
USP18Q9UMW8 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
USP18Q9UMW8 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
USP18Q9UMW8 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
USP18Q9UMW8 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
USP18Q9UMW8 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
USP18Q9UMW8 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
USP18Q9UMW8 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
USP18Q9UMW8 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
USP18Q9UMW8 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
USP18Q9UMW8 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
USP18Q9UMW8 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
USP18Q9UMW8 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
USP18Q9UMW8 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
USP18Q9UMW8 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
USP18Q9UMW8 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
USP18Q9UMW8 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
USP18Q9UMW8 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
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USP18Q9UMW8 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
USP18Q9UMW8 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
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USP18Q9UMW8 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
USP18Q9UMW8 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
USP18Q9UMW8 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
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USP18Q9UMW8 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
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USP18Q9UMW8 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
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USP18Q9UMW8 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
USP18Q9UMW8 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
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USP18Q9UMW8 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
USP18Q9UMW8 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
USP18Q9UMW8 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
USP18Q9UMW8 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
USP18Q9UMW8 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
USP18Q9UMW8 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
USP18Q9UMW8 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
USP18Q9UMW8 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
USP18Q9UMW8 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
USP18Q9UMW8 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
USP18Q9UMW8 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
USP18Q9UMW8 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
USP18Q9UMW8 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
USP18Q9UMW8 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
USP18Q9UMW8 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
USP18Q9UMW8 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
USP18Q9UMW8 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
USP18Q9UMW8 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
USP18Q9UMW8 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
USP18Q9UMW8 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
USP18Q9UMW8 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
USP18Q9UMW8 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
USP18Q9UMW8 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
USP18Q9UMW8 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
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