Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULP0

NDRG4, Protein NDRG4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDRG4Q9ULP0 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NDRG4Q9ULP0 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NDRG4Q9ULP0 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NDRG4Q9ULP0 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NDRG4Q9ULP0 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NDRG4Q9ULP0 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
NDRG4Q9ULP0 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NDRG4Q9ULP0 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NDRG4Q9ULP0 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NDRG4Q9ULP0 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NDRG4Q9ULP0 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NDRG4Q9ULP0 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NDRG4Q9ULP0 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NDRG4Q9ULP0 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NDRG4Q9ULP0 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NDRG4Q9ULP0 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NDRG4Q9ULP0 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NDRG4Q9ULP0 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NDRG4Q9ULP0 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NDRG4Q9ULP0 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NDRG4Q9ULP0 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NDRG4Q9ULP0 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
NDRG4Q9ULP0 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NDRG4Q9ULP0 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NDRG4Q9ULP0 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NDRG4Q9ULP0 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NDRG4Q9ULP0 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NDRG4Q9ULP0 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NDRG4Q9ULP0 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
NDRG4Q9ULP0 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NDRG4Q9ULP0 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NDRG4Q9ULP0 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NDRG4Q9ULP0 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NDRG4Q9ULP0 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NDRG4Q9ULP0 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NDRG4Q9ULP0 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NDRG4Q9ULP0 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NDRG4Q9ULP0 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NDRG4Q9ULP0 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NDRG4Q9ULP0 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NDRG4Q9ULP0 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NDRG4Q9ULP0 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NDRG4Q9ULP0 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NDRG4Q9ULP0 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NDRG4Q9ULP0 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NDRG4Q9ULP0 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NDRG4Q9ULP0 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NDRG4Q9ULP0 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NDRG4Q9ULP0 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NDRG4Q9ULP0 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NDRG4Q9ULP0 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NDRG4Q9ULP0 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NDRG4Q9ULP0 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NDRG4Q9ULP0 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NDRG4Q9ULP0 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NDRG4Q9ULP0 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NDRG4Q9ULP0 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NDRG4Q9ULP0 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NDRG4Q9ULP0 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NDRG4Q9ULP0 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NDRG4Q9ULP0 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NDRG4Q9ULP0 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NDRG4Q9ULP0 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NDRG4Q9ULP0 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NDRG4Q9ULP0 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NDRG4Q9ULP0 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NDRG4Q9ULP0 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NDRG4Q9ULP0 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NDRG4Q9ULP0 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NDRG4Q9ULP0 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NDRG4Q9ULP0 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NDRG4Q9ULP0 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NDRG4Q9ULP0 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NDRG4Q9ULP0 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NDRG4Q9ULP0 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NDRG4Q9ULP0 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NDRG4Q9ULP0 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NDRG4Q9ULP0 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NDRG4Q9ULP0 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NDRG4Q9ULP0 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NDRG4Q9ULP0 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NDRG4Q9ULP0 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NDRG4Q9ULP0 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NDRG4Q9ULP0 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NDRG4Q9ULP0 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NDRG4Q9ULP0 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NDRG4Q9ULP0 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NDRG4Q9ULP0 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NDRG4Q9ULP0 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NDRG4Q9ULP0 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NDRG4Q9ULP0 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NDRG4Q9ULP0 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NDRG4Q9ULP0 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NDRG4Q9ULP0 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NDRG4Q9ULP0 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NDRG4Q9ULP0 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NDRG4Q9ULP0 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NDRG4Q9ULP0 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NDRG4Q9ULP0 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NDRG4Q9ULP0 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms