Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULD4

BRPF3, Bromodomain and PHD finger-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRPF3Q9ULD4 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
BRPF3Q9ULD4 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
BRPF3Q9ULD4 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
BRPF3Q9ULD4 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
BRPF3Q9ULD4 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
BRPF3Q9ULD4 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
BRPF3Q9ULD4 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
BRPF3Q9ULD4 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
BRPF3Q9ULD4 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
BRPF3Q9ULD4 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
BRPF3Q9ULD4 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
BRPF3Q9ULD4 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
BRPF3Q9ULD4 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
BRPF3Q9ULD4 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
BRPF3Q9ULD4 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
BRPF3Q9ULD4 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
BRPF3Q9ULD4 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
BRPF3Q9ULD4 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
BRPF3Q9ULD4 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
BRPF3Q9ULD4 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
BRPF3Q9ULD4 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
BRPF3Q9ULD4 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
BRPF3Q9ULD4 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
BRPF3Q9ULD4 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
BRPF3Q9ULD4 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
BRPF3Q9ULD4 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
BRPF3Q9ULD4 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
BRPF3Q9ULD4 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
BRPF3Q9ULD4 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
BRPF3Q9ULD4 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
BRPF3Q9ULD4 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
BRPF3Q9ULD4 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
BRPF3Q9ULD4 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
BRPF3Q9ULD4 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
BRPF3Q9ULD4 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
BRPF3Q9ULD4 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
BRPF3Q9ULD4 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
BRPF3Q9ULD4 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
BRPF3Q9ULD4 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
BRPF3Q9ULD4 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
BRPF3Q9ULD4 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
BRPF3Q9ULD4 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
BRPF3Q9ULD4 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
BRPF3Q9ULD4 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
BRPF3Q9ULD4 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
BRPF3Q9ULD4 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
BRPF3Q9ULD4 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
BRPF3Q9ULD4 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
BRPF3Q9ULD4 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
BRPF3Q9ULD4 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
BRPF3Q9ULD4 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
BRPF3Q9ULD4 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
BRPF3Q9ULD4 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
BRPF3Q9ULD4 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
BRPF3Q9ULD4 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
BRPF3Q9ULD4 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
BRPF3Q9ULD4 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
BRPF3Q9ULD4 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
BRPF3Q9ULD4 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
BRPF3Q9ULD4 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
BRPF3Q9ULD4 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
BRPF3Q9ULD4 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
BRPF3Q9ULD4 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
BRPF3Q9ULD4 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
BRPF3Q9ULD4 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
BRPF3Q9ULD4 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
BRPF3Q9ULD4 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
BRPF3Q9ULD4 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
BRPF3Q9ULD4 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
BRPF3Q9ULD4 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
BRPF3Q9ULD4 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
BRPF3Q9ULD4 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
BRPF3Q9ULD4 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
BRPF3Q9ULD4 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
BRPF3Q9ULD4 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
BRPF3Q9ULD4 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
BRPF3Q9ULD4 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
BRPF3Q9ULD4 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
BRPF3Q9ULD4 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
BRPF3Q9ULD4 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
BRPF3Q9ULD4 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
BRPF3Q9ULD4 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
BRPF3Q9ULD4 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
BRPF3Q9ULD4 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
BRPF3Q9ULD4 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
BRPF3Q9ULD4 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
BRPF3Q9ULD4 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
BRPF3Q9ULD4 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
BRPF3Q9ULD4 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
BRPF3Q9ULD4 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
BRPF3Q9ULD4 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
BRPF3Q9ULD4 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
BRPF3Q9ULD4 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
BRPF3Q9ULD4 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
BRPF3Q9ULD4 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
BRPF3Q9ULD4 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
BRPF3Q9ULD4 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
BRPF3Q9ULD4 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
BRPF3Q9ULD4 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
BRPF3Q9ULD4 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms